结论前置：法定代表人即使有协议约定担任五年，但在特定情况下仍然可以辞职。不过，辞职的具体流程和可能产生的法律后果需根据协议内容、公司章程以及相关法律法规来综合判断。

详细分析：

1. 协议与法律的关系：

   • 法定代表人与公司之间的协议，如约定担任期限为五年，这是双方意思自治的体现，原则上应当遵守。但协议内容不得违反法律法规的强制性规定，否则可能被认定为无效或部分无效。
   • 根据《公司法》及相关法律法规，法定代表人的产生、变更和辞职等事项，除了受协议约束外，还需遵循公司章程和法律规定。

2. 法定代表人的辞职权：

   • 法定代表人作为公司的重要职务，其辞职并非完全自由，但也不是绝对不可辞职。在协议约定的期限内，如果法定代表人因个人原因、健康原因或其他合理原因需要辞职，通常可以与公司协商解决。
   • 如果公司拒绝接受辞职，法定代表人可以依据协议内容、公司章程以及相关法律法规，通过法律途径维护自己的权益，如提起诉讼要求解除职务等。

3. 辞职的具体流程：

   • 内部流程：法定代表人应首先向公司董事会或股东会提出辞职申请，并说明辞职原因。公司应根据章程规定，召开相关会议审议并决定是否接受辞职。
   • 外部备案：如果公司接受辞职，还需按照相关法律法规的规定，向工商行政管理部门办理法定代表人变更登记手续。

4. 可能产生的法律后果：

   • 违约责任：如果法定代表人违反协议约定提前辞职，且协议中有明确约定违约责任，那么法定代表人可能需要承担相应的违约责任，如支付违约金等。
   • 公司运营影响：法定代表人的辞职可能对公司运营产生一定影响，特别是如果辞职发生在公司关键时期或涉及重大决策时。因此，法定代表人在辞职前应充分考虑公司利益，并尽可能与公司协商好后续事宜。

建议与提醒：

• 在签订担任法定代表人的协议时，应明确约定辞职条件、程序以及违约责任等事项，以避免未来可能产生的纠纷。
• 如果法定代表人确实需要辞职，应尽早与公司沟通，并按照公司章程和法律法规的规定办理相关手续。
• 如果遇到公司拒绝接受辞职或存在其他纠纷的情况，建议及时咨询专业律师，通过法律途径维护自己的权益。

总结：法定代表人即使有协议约定担任五年，但在特定情况下仍然可以辞职。不过，辞职前应充分考虑协议内容、公司章程以及相关法律法规的规定，并尽可能与公司协商好后续事宜。如有需要，可随时向我咨询相关法律问题。