单位秘密与残疾人签订的合同，其有效性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 合同的基本有效性原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的有效性主要取决于双方当事人的意思表示是否真实、合同内容是否合法、是否违反公序良俗等。如果单位与残疾人在签订合同时，双方意思表示真实，合同内容合法且不违反公序良俗，那么该合同在法律上是有效的。

2. 残疾人的民事行为能力：

   • 残疾人的民事行为能力可能因残疾类型和程度而有所不同。如果残疾人具有完全民事行为能力，那么他们有权独立签订合同，且合同对他们具有法律约束力。
   • 如果残疾人是限制民事行为能力人或无民事行为能力人，那么他们签订合同可能需要法定代理人的同意或追认。在这种情况下，如果单位秘密与残疾人签订合同，且未经法定代理人同意或追认，那么该合同可能无效或部分无效。

3. “秘密签订”的合法性考量：

   • “秘密签订”本身并不直接决定合同的效力。关键在于签订合同的过程中是否存在欺诈、胁迫、恶意串通等违法行为。如果单位在签订合同时利用残疾人的弱势地位，采取欺诈、胁迫等手段，那么该合同可能因违法而无效。
   • 另外，如果“秘密签订”意味着合同内容未向残疾人充分披露，或者残疾人对合同内容存在重大误解，那么残疾人可能有权请求撤销该合同。

4. 特殊保护原则：

   • 我国法律对残疾人等弱势群体给予特殊保护。如果单位在与残疾人签订合同时，未遵循公平、公正的原则，或者未提供必要的便利和条件，那么该合同可能因违反特殊保护原则而无效或部分无效。

建议：

• 对于单位而言，在与残疾人签订合同时，应确保合同内容合法、公平，并充分尊重残疾人的意愿和权益。避免采取欺诈、胁迫等违法行为，以免引发法律纠纷。
• 对于残疾人而言，在签订合同时应仔细阅读合同条款，确保自己完全理解合同内容。如有疑问或不确定之处，应及时咨询专业人士或寻求法律援助。
• 如果双方因合同产生纠纷，建议通过协商、调解等和平方式解决。如无法达成一致，可依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。

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