结论：公司拖欠工资时，劳动者离职前可以与公司签订协议，但需谨慎对待协议内容，确保自身权益不受损害。以下从多个角度进行分析：
一、协议签订的合法性与合理性
合法性：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，劳动者与用人单位在平等自愿、协商一致的基础上，可以就劳动关系的变更、解除等事项签订协议。因此，在公司拖欠工资的情况下，劳动者离职前与公司签订协议，只要协议内容不违反法律法规的强制性规定，是合法的。
合理性：签订协议可以明确双方的权利义务，包括工资支付、经济补偿等事项，有助于避免离职后因工资问题产生纠纷。同时，协议也可以作为劳动者维权的重要证据。
二、协议签订的注意事项
明确工资支付情况：协议中应明确公司拖欠工资的具体金额、支付时间等，确保劳动者能够清楚了解自己的权益。
约定经济补偿：如果劳动者因公司拖欠工资而选择离职，根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动者有权要求公司支付经济补偿。因此，协议中应明确经济补偿的金额、支付方式等。
避免不利条款：劳动者在签订协议时，应仔细阅读协议条款，避免签订对公司有利而对自身不利的条款，如放弃追讨拖欠工资的权利等。
保留证据：在签订协议前，劳动者应收集并保留与拖欠工资相关的证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以备不时之需。
三、协议签订后的法律后果
协议具有法律效力：一旦双方签订协议，且协议内容合法有效，双方均应按照协议约定履行义务。如果公司未按照协议约定支付工资或经济补偿，劳动者可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
可能影响其他维权途径：如果劳动者在签订协议时放弃了部分权益，如追讨拖欠工资的权利，那么在协议签订后，劳动者可能无法再通过其他途径追讨这部分工资。因此，在签订协议前，劳动者应充分考虑自身权益的保护。
四、建议与操作
先仲裁后离职：在处理公司拖欠工资的问题时，通常建议先进行劳动仲裁，明确公司拖欠工资的事实和金额，然后再考虑是否离职。这样可以在离职前确保自己的权益得到最大程度的保护。
咨询专业律师：在签订协议前，劳动者可以咨询专业律师的意见，了解协议的法律效力和可能存在的风险，以便做出更明智的决策。作为林春凯律师，我擅长处理交通事故、婚姻家庭、劳动纠纷等领域的问题，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。
谨慎签订协议：在签订协议时，劳动者应保持谨慎态度，仔细阅读协议条款，确保自己的权益不受损害。如果对公司提出的协议内容有异议或不确定的地方，应及时与公司沟通并寻求专业律师的帮助。