结论：股东变更协议签字非本人签署，该协议并不当然无效，需结合具体情况判断；关于诉讼时效，一般情况下，请求确认合同无效的诉讼不受诉讼时效期间的限制，但若涉及因合同无效产生的返还财产或赔偿损失请求，则可能受诉讼时效限制，且自知道或应当知道权利受损之日起计算，最长不超过二十年。
一、关于股东变更协议签字非本人签署的效力问题
协议效力判断：
- 股东变更协议作为民事法律行为，其效力判断需依据《民法典》中关于民事法律行为效力的规定。若协议上的签字非本人签署，且未经本人追认，则该协议对本人不发生法律效力，即该部分协议内容无效。
- 但需注意，若存在表见代理等情形，即相对人有理由相信行为人有代理权而与之订立合同，则该合同可能对本人产生法律效力。这需要根据具体案情，如行为人的身份、权限、相对人的善意与否等因素综合判断。
工商变更登记的效力：
- 工商变更登记是公司登记机关对公司股东变更等事项的行政确认行为，其本身并不直接决定股东变更协议的效力。即使工商变更登记已完成，若股东变更协议存在无效情形，仍可通过法律途径主张协议无效。
二、关于诉讼时效问题
请求确认合同无效的诉讼时效：
- 根据相关法律规定及司法实践，请求确认合同无效的诉讼一般不受诉讼时效期间的限制。因为合同无效是自始无效，不因时间的推移而改变其无效状态。
因合同无效产生的返还财产或赔偿损失请求的诉讼时效：
- 若因股东变更协议无效而产生返还财产或赔偿损失等请求，则这些请求可能受诉讼时效期间的限制。根据《民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 但需注意，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
三、建议与行动
收集证据：
- 若您认为股东变更协议签字非本人签署且协议无效，建议尽快收集相关证据，如协议原件、签字样本、证人证言等，以证明协议上的签字非本人签署或存在其他无效情形。
咨询专业律师：
- 由于股东变更协议无效及诉讼时效问题涉及复杂的法律判断和证据收集，建议您咨询专业律师，以便更准确地评估案情、制定诉讼策略并维护您的合法权益。
考虑诉讼或仲裁：
- 根据具体情况，您可能需要通过诉讼或仲裁等法律途径来主张股东变更协议无效并寻求相应的法律救济。在此过程中，专业律师的协助将至关重要。
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