在劳动仲裁过程中，如果公司不配合进行笔迹鉴定，你可以采取以下措施来应对：
明确笔迹鉴定的必要性与法律依据：
- 笔迹鉴定在劳动仲裁中通常用于确认相关文件（如劳动合同、辞职信、工资单等）上的签名是否为员工本人所签，这对于证明案件事实至关重要。
- 根据《劳动争议调解仲裁法》及相关规定，当事人有责任提供证据支持自己的主张。如果公司拒绝配合笔迹鉴定，可能被视为未尽到举证责任，从而承担不利后果。
向劳动仲裁委员会提出申请并说明情况：
- 你可以向劳动仲裁委员会正式提出笔迹鉴定的申请，并详细说明公司不配合的情况。
- 劳动仲裁委员会会根据案件需要和双方当事人的举证情况，决定是否进行笔迹鉴定以及如何进行。
利用其他证据支持你的主张：
- 如果公司不配合笔迹鉴定，你可以积极收集其他相关证据来支持你的主张，如证人证言、电子邮件、短信记录、工资转账记录等。
- 这些证据可以形成证据链，增强你的主张的可信度。
考虑法律后果与应对策略：
- 如果公司无正当理由拒绝配合笔迹鉴定，劳动仲裁委员会可能会根据现有证据和法律规定，作出对公司不利的裁决。
- 你也可以考虑在仲裁过程中或裁决后，如果公司仍不履行相关义务，向法院申请强制执行或采取其他法律措施来维护你的权益。
具体操作建议：
- 书面申请：向劳动仲裁委员会提交书面申请，明确请求进行笔迹鉴定，并附上相关证据材料。
- 沟通协商：在提交申请前或过程中，尝试与公司进行沟通协商，说明笔迹鉴定的重要性及法律后果，争取公司的配合。
- 准备应对：如果公司仍然拒绝配合，准备好其他证据材料，并在仲裁过程中充分陈述你的观点和理由。
示例说明：
假设你在劳动仲裁中主张公司未与你签订书面劳动合同，而公司则否认这一事实并拒绝进行笔迹鉴定以确认劳动合同上的签名是否为你所签。在这种情况下，你可以向劳动仲裁委员会提出笔迹鉴定的申请，并附上你手中的其他证据（如工资单、工作证等）来支持你的主张。如果公司仍然拒绝配合，劳动仲裁委员会可能会根据现有证据和法律规定，认定公司未与你签订书面劳动合同，并裁决公司支付你相应的双倍工资差额等。
最后提醒：在整个过程中，保持冷静和理性至关重要。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更详细和专业的法律建议。