核心结论：抵押车在物流运输过程中被偷盗，物流已报警的情况下，后续处理主要涉及刑事案件推进、民事赔偿主张以及抵押权相关事宜处理这三个方面。以下是详细说明：
刑事案件推进
- 配合警方调查
- 作为车主，要积极配合警方开展调查工作。向警方提供与车辆相关的所有信息，包括但不限于车辆的购买凭证、行驶证、抵押合同（证明车辆抵押情况）、车辆特征（如颜色、型号、车牌号、车架号等）、最后一次见到车辆的时间和地点、运输合同（如果有，明确物流运输的起始地、目的地、运输时间等约定内容）以及物流公司的相关信息等。这些信息有助于警方更快地锁定嫌疑人和找回车辆。
- 按照警方的要求，随时提供必要的协助，例如协助辨认嫌疑人照片、参加相关询问或调查活动等。
- 关注案件进展
- 定期与警方沟通，了解案件的侦破情况。可以通过电话、书面询问或者到办案机关当面咨询等方式，及时掌握案件是否有新的线索、是否抓获嫌疑人、车辆是否被追回等重要信息。
- 如果案件有重大进展，如嫌疑人被抓获、车辆被找回等，要根据警方要求配合后续的处理工作，如对车辆进行辨认、提供相关证据等。
民事赔偿主张
- 确定责任主体
- 物流公司责任：根据《民法典》中关于运输合同的规定，物流公司有义务将货物（此处为车辆）安全运输到约定地点。在运输过程中车辆被盗，如果物流公司不能证明是由于不可抗力、货物本身的自然性质或者合理损耗以及托运人（车主）的过错造成的，物流公司应当承担赔偿责任。
- 其他可能责任主体：如果车辆被盗是由于第三方（如停车场管理不善导致车辆被盗，停车场管理方可能存在一定责任）的原因造成的，在确定物流公司承担责任后，物流公司可以根据其与第三方的法律关系（如合同关系）向第三方追偿；车主也可以直接根据相关法律规定向有责任的第三方主张赔偿。
- 收集证据
- 收集与物流运输相关的所有证据，包括运输合同、付款凭证（证明与物流公司存在运输服务交易）、车辆价值证明（如购车发票、车辆评估报告等，用于确定车辆被盗时的价值）、报警回执、与物流公司沟通的记录（如聊天记录、邮件等，证明车主已及时告知物流公司车辆被盗情况并要求处理）等。这些证据将有助于在主张民事赔偿时证明物流公司的违约行为以及车辆的价值，从而确定赔偿金额。
- 协商或诉讼
- 协商解决：车主可以先与物流公司进行协商，尝试通过友好协商的方式解决赔偿问题。在协商过程中，要明确提出自己的赔偿要求，包括车辆的价值、因车辆被盗产生的其他损失（如因车辆抵押可能产生的利息损失、处理此事产生的交通费、误工费等），并说明赔偿的依据。如果双方能够达成一致意见，可以签订书面赔偿协议，明确赔偿金额、支付方式和时间等条款。
- 诉讼解决：如果协商不成，车主可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，要按照法院的要求提交相关证据，参加庭审活动，通过法律途径维护自己的合法权益。法院将根据双方提供的证据和相关法律规定，判决物流公司是否承担赔偿责任以及赔偿的具体金额。
抵押权相关事宜处理
- 通知抵押权人
- 车主应及时将车辆被盗的情况通知抵押权人。因为车辆作为抵押物，其状态的变化可能会影响抵押权人的权益。通知抵押权人可以让其了解情况，并根据具体情况采取相应的措施，如调整还款计划、要求车主提供其他担保等。
- 协商抵押权实现方式
- 如果车辆最终无法追回，车主需要与抵押权人协商抵押权的实现方式。根据《民法典》的规定，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，抵押权人可以与抵押人协议以抵押财产折价或者以拍卖、变卖该抵押财产所得的价款优先受偿。双方可以协商确定车辆的价值（如果车辆无法追回，可能需要根据车辆被盗时的市场价值进行评估），并按照抵押合同的约定和相关法律规定处理抵押权。如果协商不成，抵押权人也可以向法院提起诉讼，要求实现抵押权。
在整个处理过程中，车主要注意保留好所有相关的证据和文件，以便在需要时能够及时提供。如果对法律程序和相关规定不熟悉，可以进一步向我咨询，我会根据具体情况为你提供更详细的法律建议。