法定不起诉和存疑不起诉在适用上并不存在一个固定的“顺序”，而是根据案件的具体情况和证据状况来独立判断并适用的。以下是对这两种不起诉类型的详细解释和比较：
一、法定不起诉
定义与适用条件：
- 法定不起诉，也称为绝对不起诉，是指人民检察院对案件进行审查后，认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪或依法不应追究刑事责任，从而作出的不将犯罪嫌疑人诉至人民法院审判的处理决定。
- 适用条件主要包括：情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；以及其他法律规定免予追究刑事责任的情形。
法律后果：
决定程序：
- 人民检察院在审查起诉过程中，一旦发现案件存在法定不起诉的情形，应当由检察长决定作出不起诉决定。
二、存疑不起诉
定义与适用条件：
- 存疑不起诉，也称为证据不足不起诉，是指对于二次补充侦查的案件，如果人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉决定。
- 适用条件主要是证据不足，无法证明犯罪嫌疑人实施了被指控的犯罪行为，或证据间存在重大矛盾，使得犯罪事实难以认定。
法律后果：
- 被不起诉人并非在法律上被绝对认定为无罪，而是基于现有证据不能达到起诉的标准而作出的暂时性决定。如果后续发现了新的证据，且该证据足以证明犯罪嫌疑人构成犯罪，符合起诉条件，人民检察院可以重新提起公诉。
决定程序：
- 程序相对复杂。首先，在案件侦查终结移送审查起诉后，人民检察院认为证据不足的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查，补充侦查以二次为限。经过二次补充侦查后，如果人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，需要由检察委员会讨论决定是否作出不起诉决定。
三、法定不起诉与存疑不起诉的比较
适用条件不同：
- 法定不起诉是基于案件本身不符合起诉条件或依法不应追究刑事责任而作出的决定。
- 存疑不起诉则是因证据不足无法证明犯罪嫌疑人构成犯罪而作出的决定。
法律后果不同：
- 法定不起诉的被不起诉人在法律上被认定为无罪。
- 存疑不起诉的被不起诉人并非在法律上被绝对认定为无罪，而是基于现有证据不能达到起诉的标准。
决定程序不同：
- 法定不起诉的决定程序相对直接明确，主要是对案件是否符合法定情形进行审查判断。
- 存疑不起诉的决定程序相对复杂，需要经过补充侦查和检察委员会讨论等环节。
总结与建议：
在实际操作中，人民检察院会根据案件的具体情况和证据状况来判断应该适用哪一种不起诉决定。如果案件存在法定不起诉的情形，如犯罪已过追诉时效期限或犯罪嫌疑人、被告人死亡等，人民检察院将直接作出法定不起诉决定。如果案件证据不足，无法证明犯罪嫌疑人构成犯罪，人民检察院将经过补充侦查后，根据证据情况决定是否作出存疑不起诉决定。
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