结论是：个体户主在找不到员工的情况下，仍然可以申请劳动仲裁，但能否成功取决于是否能提供充分证据证明与员工之间存在劳动关系及具体争议事项。以下从多个角度进行分析：

一、劳动仲裁的申请条件

劳动仲裁是解决劳动争议的一种重要方式，其申请条件主要包括：

1. 存在劳动关系：这是申请劳动仲裁的基础。个体户主需要证明与员工之间存在劳动关系，这通常可以通过劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录等证据来证明。
2. 有具体的仲裁请求和事实、理由：个体户主需要明确自己的仲裁请求，如要求支付工资、经济补偿金等，并说明提出这些请求的事实和理由。

二、找不到员工对劳动仲裁的影响

1. 证据收集难度增加：如果个体户主找不到员工，可能会面临证据收集困难的问题。例如，无法直接获取员工的陈述或证言，也无法要求员工提供相关证据。然而，这并不意味着无法申请劳动仲裁，个体户主仍然可以通过其他方式收集证据，如寻找目击者、调取监控录像等。
2. 仲裁程序可能受影响：在劳动仲裁过程中，仲裁庭可能需要通知员工参加仲裁活动。如果个体户主找不到员工，仲裁庭可能会通过公告等方式送达相关法律文书。这可能会延长仲裁程序的时间，但并不会影响仲裁的进行。

三、应对策略与建议

1. 积极收集证据：个体户主应尽可能收集与员工存在劳动关系及具体争议事项相关的证据。这些证据可以包括书面合同、工资支付记录、工作证、考勤记录、同事证言等。
2. 寻求法律援助：如果个体户主在证据收集或仲裁程序方面遇到困难，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、协助收集证据、代表参加仲裁活动等服务。
3. 关注仲裁时效：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。个体户主应在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁，以免超过时效期间而丧失胜诉权。

四、可能面临的法律后果

1. 如果仲裁请求得到支持：如果个体户主能够提供充分证据证明与员工之间存在劳动关系及具体争议事项，且仲裁庭认为其仲裁请求合理合法，那么仲裁庭可能会裁决支持个体户主的仲裁请求。
2. 如果仲裁请求被驳回：如果个体户主无法提供充分证据或仲裁庭认为其仲裁请求缺乏事实和法律依据，那么仲裁庭可能会裁决驳回个体户主的仲裁请求。在这种情况下，个体户主可以考虑通过诉讼等其他方式解决争议。

最后，建议个体户主在遇到劳动争议时，及时咨询专业律师并积极收集证据，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。