以项目保证金为由写的借条，其合法性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、合法情形
真实借贷关系：
- 如果双方确实存在借贷关系，且借条中明确记载了借款金额、借款期限、利息等关键要素，同时借款人确实收到了借款，那么这份借条就是合法的。即使借条中提到了“项目保证金”，但只要这不影响借贷关系的本质，且双方对此有明确的约定和认可，借条仍然具有法律效力。
保证金转化为借款：
- 在某些情况下，项目保证金可能因项目未能如期进行或其他原因而转化为借款。如果双方对此有明确的书面协议或口头约定，并且借款人同意将保证金作为借款处理，那么以项目保证金为由写的借条也是合法的。
二、不合法情形
名为借贷，实为其他法律关系：
- 如果双方之间并不存在真实的借贷关系，而是以项目保证金为名进行其他交易（如投资、合作等），但为了规避法律风险或出于其他目的而签订了借条，那么这份借条可能因缺乏真实的借贷意思表示而被认定为无效。
借条内容违法或违背公序良俗：
- 如果借条中的内容违反了法律法规的强制性规定（如高利贷、非法集资等），或者违背了公序良俗（如以不正当手段获取借款等），那么这份借条也是不合法的。
借款人未实际收到借款：
- 如果借条虽然签订了，但借款人并未实际收到借款，那么这份借条在法律上也是无效的。因为借贷关系的成立需要以借款的实际交付为要件。
三、法律建议
明确借贷关系：
- 在签订借条时，应明确双方之间的借贷关系，包括借款金额、借款期限、利息等关键要素，并确保借款人实际收到借款。
避免混淆法律关系：
- 如果双方之间存在其他法律关系（如投资、合作等），应签订相应的合同或协议，避免将其他法律关系与借贷关系混淆。
遵守法律法规：
- 在签订借条时，应遵守相关的法律法规，避免涉及高利贷、非法集资等违法行为。
保留证据：
- 在借贷过程中，应保留好相关的证据（如转账记录、聊天记录等），以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
举例说明：假设甲和乙之间签订了一份借条，借条中记载甲向乙借款10万元，借款期限为一年，利息为年利率10%，并注明该借款原为项目保证金。如果甲确实收到了乙的10万元借款，并且双方对此有明确的约定和认可，那么这份借条就是合法的。但如果甲并未实际收到借款，或者双方之间并不存在真实的借贷关系，而是以项目保证金为名进行其他交易，那么这份借条就可能因缺乏真实的借贷意思表示而被认定为无效。
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