您好，关于“种苗管理办法由省级农业部门制定”这一规定，其法律依据主要来源于《农作物种子生产经营许可管理办法》以及部分地方性法规，如《山东省种子条例》等。具体来说：
《农作物种子生产经营许可管理办法》第三十五条：该条款明确规定了生产经营种苗等非籽粒种子的企业，应当具备相适应的设施、设备、品种及人员，并且具体的管理办法由省级农业农村部门来制定。这是从国家层面为省级农业部门制定种苗管理办法提供了法律依据。
地方性法规的补充：以《山东省种子条例》为例，其第三十条也作出了类似的规定，即生产经营种苗等非籽粒种子的企业，需要满足一定的条件，并且具体的管理办法由省级农业农村部门制定。这样的地方性法规进一步细化了国家层面的规定，使其更符合地方实际情况。
综合以上两点，我们可以明确，种苗管理办法由省级农业部门制定这一规定，是有明确的法律依据的。它既体现了国家对种苗产业管理的重视，也赋予了省级农业部门根据地方实际情况制定具体管理办法的权力。
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