在施工联合体中，两个总包单位下的农民工工资发放责任，主要取决于他们之间的合同约定以及实际用工情况。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 如果两个总包单位在联合体协议或内部合同中明确约定了农民工工资的支付责任方，那么应当按照合同约定来执行。例如，如果合同中规定由其中一个总包单位负责支付所有农民工工资，那么该单位就应当承担这一责任。
   • 合同约定是确定责任的重要依据，因为它反映了双方的真实意愿和协商结果。因此，在处理此类纠纷时，首先应当审查相关合同文件。

2. 实际用工情况：

   • 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么就需要根据实际用工情况来确定责任。这通常涉及到农民工与哪个总包单位建立了事实上的劳动关系。
   • 例如，如果农民工是由其中一个总包单位直接招聘、管理并支付工资的，那么该单位就应当承担支付工资的责任。如果农民工虽然是在联合体项目上工作，但实际上是受另一个总包单位（或分包单位）的指挥和管理，那么工资支付责任可能就归属于该单位。

3. 法律责任与连带责任：

   • 根据《保障农民工工资支付条例》等相关法律法规，用人单位（包括总包单位和分包单位）有义务按时足额支付农民工工资。如果某个总包单位未履行这一义务，农民工有权向其追讨工资，并可以要求相关部门进行查处。
   • 在某些情况下，如果联合体中的某个总包单位无力支付工资，或者存在逃避支付工资的行为，其他总包单位可能因连带责任而被要求共同承担支付责任。这通常取决于具体的法律规定和案件事实。

4. 建议与措施：

   • 对于农民工来说，如果遇到工资支付问题，首先应当与直接用工的总包单位或分包单位进行协商，寻求解决方案。
   • 如果协商无果，可以向当地的劳动保障监察机构投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
   • 对于总包单位来说，为了避免工资支付纠纷，应当在联合体协议中明确约定工资支付责任，并加强对分包单位的管理和监督，确保农民工工资得到按时足额支付。

总结来说，施工联合体中两个总包单位下的农民工工资发放责任，应当根据合同约定和实际用工情况来确定。在处理此类问题时，建议农民工和总包单位都积极了解相关法律法规，明确各自的权利和义务，以避免不必要的纠纷和损失。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。