结论：公司加班未按照基本工资计算加班费，这一做法是否违法需分情况讨论，但在多数情况下，这种做法是违法的。

分析说明：

1. 加班费计算基数的一般规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，加班费通常应以劳动者正常工作时间工资为基数进行计算。这里的“正常工作时间工资”一般指的是基本工资，但也可能包括其他固定发放的、与岗位相关的津贴、补贴等，具体需根据劳动合同、公司规章制度以及地方性法规来确定。

2. 加班未按基本工资计算的情况分析：

   • 若劳动合同或公司规章制度明确规定加班费计算基数为基本工资：则公司应按照基本工资作为加班费的计算基数。若公司未按照此规定执行，即加班未按基本工资计算，则构成违法。
   • 若劳动合同或公司规章制度未明确规定加班费计算基数，或规定不明确：则通常应参照劳动者正常工作时间的工资（包括基本工资及可能的其他固定津贴、补贴）作为加班费的计算基数。在此情况下，若公司仅按基本工资计算加班费，而未考虑其他固定发放的津贴、补贴等，也可能构成违法，具体取决于地方性法规或司法实践的解释。
   • 特殊情况：在某些特定行业或岗位，可能存在特殊的加班费计算方式或标准，这通常会在劳动合同、公司规章制度或地方性法规中明确规定。若存在此类特殊规定，且公司按照这些规定执行，则可能不构成违法。

3. 法律后果：

   • 若公司加班未按基本工资（或未按照劳动合同、公司规章制度、地方性法规规定的加班费计算基数）计算加班费，劳动者有权向公司提出异议，并要求公司补发加班费。
   • 若公司拒绝补发，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁，甚至提起诉讼，以维护自己的合法权益。

建议：

• 劳动者：应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解加班费的计算方式和基数。若发现公司加班未按基本工资计算加班费，应及时与公司沟通，要求补发。若公司拒绝，可寻求法律援助或向相关部门投诉。
• 公司：应严格遵守劳动法律法规，明确加班费的计算方式和基数，并在劳动合同和公司规章制度中予以明确。同时，应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识，避免因加班费计算问题而引发的法律纠纷。

示例：

假设某劳动者的基本工资为4100元/月，且每月有固定发放的交通补贴500元。若劳动合同或公司规章制度规定加班费计算基数为基本工资加交通补贴，则加班费应按照4600元/月为基数进行计算。若公司仅按4100元/月为基数计算加班费，则构成违法，劳动者有权要求公司补发差额部分。