违规渔船被抓以后，轮机长可能面临的处罚主要取决于违规的具体性质、情节严重程度以及相关法律法规的规定。以下是一些可能的情况及相应的处罚：
行政处罚：
- 如果渔船违规行为较轻，如未携带必要的证件、未按规定进行渔业活动等，轮机长作为渔船的重要管理人员，可能会受到渔业行政主管部门的行政处罚。这些处罚可能包括警告、罚款、没收违法所得、暂扣或吊销渔业船员证书等。具体罚款数额会根据违规行为的性质和情节严重程度而定，例如，根据《中华人民共和国渔业法》的相关规定，对于无证捕捞等行为，可以处以罚款，并没收渔获物和违法所得。
刑事处罚：
- 如果渔船违规行为严重，如非法捕捞、使用禁用渔具或方法捕捞、捕捞国家重点保护的珍贵、濒危水生野生动物等，且情节严重构成犯罪的，轮机长作为直接责任人员，可能会受到刑事处罚。这些处罚可能包括有期徒刑、拘役、罚金等。例如，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法捕捞水产品罪可以处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金。
其他责任：
- 除了行政处罚和刑事处罚外，轮机长还可能面临其他责任，如因违规行为导致的渔业资源损失赔偿、对渔船其他成员的赔偿责任等。这些责任的具体承担方式和数额会根据实际情况和相关法律法规的规定来确定。
在处理此类案件时，会综合考虑以下因素：
- 违规行为的性质：是故意违规还是过失违规，违规行为是否涉及非法捕捞、破坏渔业资源等严重问题。
- 情节严重程度：违规行为的持续时间、规模、对渔业资源的影响程度等。
- 轮机长的责任大小：轮机长在违规行为中的具体作用、是否知情、是否采取措施制止等。
建议：
- 如果轮机长面临此类情况，应积极配合相关部门的调查和处理工作，如实陈述事实，提供相关证据。
- 同时，轮机长也可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律责任和后果，以便更好地维护自己的合法权益。
最后需要强调的是，渔业资源的保护和合理利用是每个人的责任。轮机长作为渔船的重要管理人员，更应严格遵守相关法律法规，确保渔业活动的合法性和可持续性。如有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。