在商业交易中，关于付款方自己开发票是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体的业务场景和行业规定来判断。
首先，我们要明确的是，在大多数常规的商业交易中，发票的开具通常遵循“收款方给付款方开票”的原则。这是基于交易的本质，即收款方提供了商品或服务，因此有责任和义务向付款方提供相应的交易凭证——发票。
然而，也存在一些特殊情况，使得付款方需要给收款方开具或提供发票：
特定行业与业务场景：
- 农产品收购：当企业向农业生产者个人收购自产农产品时，由于农业生产者个人难以自行开票，因此由付款方（即收购企业）开具农产品收购发票。这是税法明确规定的，用于企业的成本核算及抵扣进项税额。
- 废旧物资收购（部分情况）：虽然自2009年起相关政策调整取消了废旧物资发票的抵扣规定，但在某些特殊业务场景和地区政策下，可能仍存在付款方开具类似发票的情况。这需要严格遵守当地的相关规定。
- 税务机关委托代征：在税务机关委托某些单位代征税款的情况下，如委托交通运输部门代征车船税，代征单位在收取税款后需向纳税人开具合法、有效的完税凭证或发票。
反向收费、退款及预付款处理：
- 在某些情况下，如收款方未能提供服务或商品，或双方协商退款，而付款方已预付款项时，虽然不直接由付款方开票，但付款方可能需要提供支付证明或收据以协助退款流程。这通常通过收据或其他形式的退款证明来实现，而非标准发票。
- 对于预付款或定金的退还，同样不是标准的发票流程，但付款方可能需要出具类似凭证以证明退款金额和原因。
特殊行业与代理服务：
- 在某些特殊行业，如旅游业，旅行社可能代表客户向服务商支付费用，并可能向客户开具发票，尽管服务实际上是由服务商提供的。这是受行业惯例或法律法规特别规定的影响。
- 在代理或中介服务中，付款方作为代理商或中介代表第三方支付费用，并根据合同或协议要求收款方开具发票给第三方。此时，付款方只是作为中间人传递发票，并非直接给收款方开票。
结论与建议：
综上所述，付款方自己开发票是否合法，取决于具体的业务场景和行业规定。在遇到此类情况时，企业应严格遵守相关法律法规和行业规范，确保发票的合法性、有效性和准确性。如果不确定自己的操作是否合规，建议咨询专业的会计或税务顾问，以避免潜在的税务风险。同时，企业也应加强内部管理，确保发票的开具和接收都符合相关规定，以维护自身的合法权益。