要申请调查令查小三与丈夫的银行流水，需向法院申请，且通常需要请律师协助。具体分析如下：

1. 申请调查令的地点
   申请调查令需向受理您离婚案件（或相关诉讼案件）的法院提出。例如，若您已起诉离婚，应向审理该案的基层法院（如区法院）提交申请；若案件在上诉阶段，则需向对应的中级法院申请。
   关键点：调查令的申请必须与诉讼案件关联，且由承办案件的法院审查决定是否签发。

2. 是否需要请律师
   虽然法律未强制要求必须委托律师申请调查令，但实践中强烈建议委托律师办理，原因如下：

   • 程序复杂性：申请需提交书面材料（如调查令申请书、证据线索清单等），格式和内容需符合法院要求，律师更熟悉流程，能避免因材料瑕疵被驳回。
     
   • 证据合法性：律师可协助判断银行流水是否属于“必要证据”（如证明配偶与第三者存在经济往来、转移财产等），避免申请被法院以“与案件无关”为由拒绝。
     
   • 执行效率：律师持调查令可直接到银行调取流水，银行通常需核对律师证件和调查令真伪，非专业人士可能因手续不全被拒。
     

3. 特殊情况说明
   若您因经济困难无法委托律师，可尝试自行申请，但需注意：

   • 提前联系法院立案庭或承办法官，确认所需材料清单（如身份证、起诉状、证据线索等）；
     
   • 申请书中需明确说明调查目的（如证明配偶过错、分割共同财产等），并附初步证据（如聊天记录、转账记录等）；
     
   • 若银行拒绝配合，需及时联系法院协调，避免延误诉讼进程。
     

行动建议：立即委托律师起草申请书并提交法院，同时收集其他证据（如配偶与第三者的同居证明、财产转移线索等），形成完整证据链，以提高诉讼成功率。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。