在处理原告按民间借贷纠纷起诉后查明不是借贷纠纷的情况时，确定管辖法院需综合考虑多个因素，并依据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定来进行。以下是对此问题的详细解答：
一、基本管辖原则
法定管辖：
- 一般地域管辖：遵循“原告就被告”的原则，即案件应由被告住所地的人民法院管辖。若被告为公民，且其住所地与经常居住地不一致，则由经常居住地的人民法院管辖；若被告为法人或其他组织，则由其住所地的人民法院管辖。
- 特殊地域管辖：在合同纠纷中，案件可由被告住所地或合同履行地的人民法院管辖。对于民间借贷纠纷，若未约定或约定不明合同履行地，通常以接受货币一方所在地为合同履行地。
约定管辖：
- 借贷双方有权通过书面协议选择与争议有实际联系的地点（如被告住所地、合同履行地、合同签订地等）的人民法院作为管辖法院。但这一约定必须明确且合法，不得违反级别管辖和专属管辖的规定。
二、合同履行地的确定
- 有明确约定：若借款合同中明确约定了合同履行地，则按照该约定来确定管辖法院。
- 无约定或约定不明：在未约定或约定不明的情况下，接收货币一方所在地被视为合同履行地。例如，在出借人要求借款人还款的情境中，出借人所在地即为合同履行地。
三、特殊情况下的管辖确定
专属管辖的排除：
- 民间借贷纠纷通常不涉及不动产等专属管辖的情形，因此应排除专属管辖的适用。
级别管辖的遵守：
- 在选择管辖法院时，必须确保所选法院符合级别管辖的要求。这通常取决于案件的性质、标的额等因素。
网络借贷平台的特殊情况：
- 若纠纷涉及网络借贷平台，且平台提供者参与了借贷活动或承担了相应责任，那么管辖法院的确定可能涉及平台运营主体所在地等因素。此时，需根据具体情况和相关法律规定来确定管辖法院。
四、实际操作建议
准确识别合同性质：
- 在起诉前，应准确识别合同性质，确保案件属于民间借贷纠纷或类似性质，以便正确选择管辖法院。
合理选择管辖法院：
- 在选择管辖法院时，应综合考虑诉讼成本、执行便利性等因素。例如，若被告财产主要集中在某一地区，选择该地区的法院管辖可能更有利于判决的执行。
咨询专业律师：
- 由于法律问题的复杂性和专业性，建议在起诉前咨询专业律师，以获取更具体的法律意见和指导。律师可以根据案件的具体情况和相关法律规定，为你提供更准确的管辖法院建议。
五、若查明不是借贷纠纷后的处理
- 若在诉讼过程中查明案件并非民间借贷纠纷，而是其他类型的纠纷（如合同纠纷、侵权纠纷等），则应根据新查明的纠纷类型和相关法律规定，重新确定管辖法院。这可能涉及对合同履行地、侵权行为地等因素的重新评估和判断。
综上所述，确定管辖法院是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多个因素和相关法律规定。在实际操作中，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和指导，以确保你的权益得到充分保障。