结论：酒店给客人虚开1000元发票的行为，可能涉及违法甚至犯罪，具体处理方式需根据虚开发票的性质、目的及后果来综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律定性
行政违法：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，任何单位和个人不得虚开发票。虚开发票，包括为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，以及介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。
- 酒店若给客人虚开1000元发票，且该发票与实际消费不符，即构成虚开发票的行政违法行为，税务机关可依法对酒店进行处罚，包括罚款、没收违法所得等。
刑事犯罪：
- 若酒店虚开发票的行为情节严重，如虚开税款数额较大或者造成国家税款损失较大等，则可能构成虚开发票罪。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，虚开本法第二百零五条规定以外的其他发票，情节严重的，处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
二、处理方式
内部处理：
- 酒店应立即停止虚开发票的行为，并内部调查虚开发票的原因、目的及涉及的人员。
- 对涉事员工进行严肃处理，包括警告、罚款、解雇等，以儆效尤。
- 加强内部管理，完善发票开具流程，确保发票的真实性和合法性。
税务处理：
- 酒店应主动向税务机关报告虚开发票的情况，并配合税务机关的调查和处理。
- 根据税务机关的要求，补缴因虚开发票而少缴的税款及滞纳金。
- 接受税务机关的处罚，如罚款、没收违法所得等。
法律救济：
- 若酒店因虚开发票行为被税务机关处罚或面临刑事指控，且认为处罚或指控不当，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
- 在行政复议或行政诉讼过程中，酒店应提供充分的证据证明自己的清白或减轻处罚的理由。
三、法律后果
行政后果：
- 酒店可能面临税务机关的罚款、没收违法所得等行政处罚。
- 酒店的税务信用等级可能受到影响，进而影响其未来的经营和发展。
刑事后果：
- 若酒店虚开发票的行为构成犯罪，相关责任人员可能面临有期徒刑、拘役或管制等刑事处罚。
- 酒店还可能面临罚金等经济处罚。
四、建议与预防
加强法律意识：
- 酒店应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识和合规意识。
- 定期组织员工学习相关法律法规，确保员工了解并遵守发票开具等财务规定。
完善内部管理：
- 酒店应建立健全的内部管理制度，包括发票开具、财务管理等方面的制度。
- 加强对发票开具流程的监督和管理，确保发票的真实性和合法性。
及时咨询与应对：
- 若酒店面临税务机关的调查或处罚，应及时咨询专业律师的意见，了解自己的权利和义务。
- 根据律师的建议，积极配合税务机关的调查和处理，争取减轻处罚或避免刑事指控。
最后，酒店给客人虚开1000元发票的行为可能涉及违法甚至犯罪，酒店应高度重视并立即采取措施加以纠正。若您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。