针对您提出的“法人被留置公司员工怎么发工资”的问题，这确实是一个涉及法律和企业规章制度的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，法人被留置这一情况，主要影响的是法人本人，即公司的法定代表人或高级管理人员，而并不直接决定公司其他员工的工资发放。公司员工的工资发放，主要依据的是公司的规章制度、劳动合同以及相关法律法规。
一、留置期间公司员工的工资处理
对于普通员工：
- 如果公司有明确的规章制度关于员工在特殊情况（如法人被留置）下的工资发放，那么应按照规章制度执行。
- 若无相关规定，公司应综合考虑多种因素，如公司的经营状况、员工的实际工作情况等，来决定是否停发工资或采取其他措施。但通常情况下，除非公司面临严重的经营困难或法律纠纷，否则不应随意停发员工工资。
对于与法人有直接关联或受法人行为影响的员工：
- 如果这些员工的工作性质、职责或薪酬与法人有直接关联，且法人的被留置对他们的工资产生了影响，那么公司应根据实际情况，结合相关法律法规和劳动合同，进行妥善处理。例如，如果法人的被留置导致公司某些业务无法正常进行，进而影响了这些员工的薪酬，公司应与员工进行沟通，说明情况，并寻求合理的解决方案。
二、留置后公司员工的工资处理
- 如果法人经调查后没有违法犯罪事实，且公司的经营状况未受影响，那么公司应恢复正常运营，员工的工资也应按照正常流程发放。
- 如果法人经调查存在违法犯罪事实，且这一事实对公司的经营产生了重大影响，那么公司可能需要根据实际情况调整薪酬政策或进行裁员等。但在此过程中，公司必须严格遵守相关法律法规，保障员工的合法权益。
三、额外建议
- 加强沟通：公司应与员工保持密切沟通，及时说明法人的被留置情况以及可能对公司和员工产生的影响，以消除员工的疑虑和不安。
- 依法依规处理：在处理工资发放问题时，公司必须严格遵守相关法律法规和劳动合同的规定，确保员工的合法权益得到保障。
- 寻求专业帮助：如果公司在处理这一问题时遇到困难或疑问，可以寻求专业律师或人力资源咨询机构的帮助，以确保处理方式的合法性和合理性。
综上所述，法人被留置并不直接决定公司员工的工资发放。公司应根据自身的规章制度、劳动合同以及相关法律法规来妥善处理这一问题，并确保员工的合法权益得到充分保障。