当遇到被告不配合办理股权变更工商登记的情况时，这确实是一个比较棘手的问题，但我们可以按照以下步骤来应对和解决：
一、明确原因并尝试沟通协商
了解不配合的具体原因：
- 首先，需要弄清楚被告不配合的具体原因。这可能是因为对股权变更存在异议、认为变更条件不满足、或者有其他个人原因等。
- 可以通过书面通知、电话沟通或面对面会议等方式，向被告明确表达股权变更的意愿和必要性，并询问其不配合的具体原因。
补充和完善相关材料：
- 根据被告提出的异议或工商局可能的要求，及时补充和完善股权变更所需的申请材料。
- 确保所有文件齐全、真实、有效，并符合法定形式和要求。
积极沟通协商：
- 在了解原因后，尝试与被告进行积极沟通，解释股权变更的合法性和合理性。
- 寻求双方都能接受的解决方案，如调整变更条件、提供额外保障等。
二、依法采取法律手段
申请行政复议：
- 如果被告的不配合行为导致工商局无法办理变更登记，且你认为工商局的不作为或拒绝行为侵犯了你的合法权益，可以依据《中华人民共和国行政复议法》的规定，向上一级行政机关或同级人民政府申请行政复议。
- 在申请行政复议时，需要提交复议申请书及相关证据材料，详细说明请求和理由。
提起行政诉讼：
- 如果对行政复议结果不满意，或者工商局在法定期限内未作出答复，你还可以依据《中华人民共和国行政诉讼法》的规定，向人民法院提起行政诉讼。
- 在提起诉讼前，建议咨询专业律师，了解诉讼程序和注意事项，确保诉讼的合法性和有效性。
三、寻求其他途径协助解决
投诉举报：
- 如果认为被告或工商局的工作人员存在违法违纪行为，可以向其上级主管部门或纪检监察部门投诉举报。
- 提供详细的证据材料，说明违法违纪的具体情况和影响。
行业协会或商会协助：
- 联系相关的行业协会或商会，寻求他们的帮助和支持。
- 行业协会或商会可能具有更丰富的行业经验和资源，能够提供更专业的建议和协助。
四、注意事项
遵守法律法规：
- 在处理此类问题时，务必遵守相关法律法规和程序规定，不得采取非法手段或行为。
保留证据材料：
- 在整个过程中，注意保留好相关证据材料，如申请书、回执、沟通记录、法律文书等。
- 这些证据材料在后续的法律程序中可能起到关键作用。
及时跟进处理进度：
- 密切关注处理进度，及时了解最新情况。
- 根据实际情况调整应对策略，确保问题得到及时解决。
综上所述，面对被告不配合办理股权变更工商登记的情况，我们需要明确原因、积极沟通协商、依法采取法律手段，并寻求其他途径协助解决。同时，也要注意遵守法律法规、保留证据材料，并及时跟进处理进度。希望这些建议能对你有所帮助。