结论：针对您提出的“起诉医疗期合同到期会自动延续，但法官要求改为赔偿否则驳回”的情况，这通常意味着法官认为您的诉求（合同自动延续）在法律上可能难以得到支持，而改为赔偿可能是更符合法律规定的救济方式。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 医疗期合同到期与自动延续的法律问题：

   • 医疗期定义：医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。它并非一个固定的合同期限，而是根据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予3个月到24个月的医疗期。
   • 合同到期与医疗期：在医疗期内，劳动合同到期应顺延至医疗期满。但医疗期满后，如果职工仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以依据《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同，并支付相应的经济补偿。
   • 自动延续的误解：您可能误解了医疗期合同到期的法律后果。医疗期合同到期并不意味着合同会自动延续，而是需要根据职工的医疗情况和用人单位的实际情况来决定是否续签或解除合同。

2. 法官要求改为赔偿的法律依据：

   • 赔偿的合理性：如果法官认为您的合同自动延续诉求难以得到法律支持，而您又因医疗期无法工作遭受了损失，那么改为赔偿可能是更合理的救济方式。赔偿可以包括医疗期内的工资、医疗费用、经济补偿等。
   • 法律依据：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在解除劳动合同时，应支付经济补偿。如果因用人单位的原因导致合同无法继续履行，职工还有权要求赔偿损失。

3. 应对策略与建议：

   • 接受法官建议：如果法官的建议符合您的实际情况和法律规定，您可以考虑接受法官的建议，改为要求赔偿。这有助于您更快地获得法律救济，减少诉讼成本和时间。
   • 提供证据支持：如果您坚持要求合同自动延续，您需要提供充分的证据证明您的医疗期尚未结束，且您有能力继续履行合同。这可能包括医疗证明、工作能力评估报告等。
   • 咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，建议您咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况和法律规定，为您提供更具体的法律建议和诉讼策略。

4. 可能的法律后果：

   • 如果接受赔偿：您将获得一定的经济补偿，以弥补因医疗期无法工作而遭受的损失。但您将失去继续履行合同的机会。
   • 如果坚持合同自动延续：如果法院最终不支持您的诉求，您可能会面临诉讼失败的风险，并需要承担相应的诉讼费用。同时，您也可能错过获得赔偿的最佳时机。

进一步思考：在处理此类医疗期合同纠纷时，您需要充分考虑自己的实际情况和法律规定。如果您对法律程序或法律规定不熟悉，建议您及时咨询专业律师的意见。作为专注于合同纠纷领域的律师，我可以为您提供专业的法律咨询和诉讼服务。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。