在合同执行过程中发生事故并被主管机关调查期间，合同是否继续执行，这主要取决于合同的具体条款、事故的性质以及主管机关的调查要求，不能一概而论。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同条款的约定：

   • 首先，应仔细审查合同中是否有关于在发生事故或被调查期间合同执行的具体条款。有些合同可能会明确规定，在特定情况下（如事故、调查等），合同的执行可以暂停、延期或终止。
   • 如果合同中有此类条款，那么双方应严格按照合同约定执行。例如，合同可能规定，在事故调查期间，双方应暂停合同执行，直至调查结果出来或达到某种条件后再恢复执行。

2. 事故的性质与影响：

   • 事故的性质和严重程度也会影响合同的执行。如果事故对合同的执行造成了实质性障碍（如设备损坏、人员伤亡等），那么合同可能无法继续执行，或者需要调整执行方式。
   • 此外，如果事故导致了合同目的无法实现（如货物毁损导致无法交付），那么合同可能面临终止的风险。

3. 主管机关的调查要求：

   • 主管机关的调查可能会对合同的执行产生影响。如果调查要求双方暂停合同执行以配合调查，那么双方应遵守这一要求。
   • 然而，如果调查并不直接涉及合同的执行，或者调查要求并不妨碍合同的继续执行，那么双方应继续履行合同义务。

4. 法律后果与风险考量：

   • 在决定是否继续执行合同时，双方还应考虑法律后果和风险。如果继续执行合同可能违反法律法规或主管机关的要求，那么可能会面临法律责任和处罚。
   • 另一方面，如果暂停或终止合同执行可能导致违约责任或经济损失，那么双方也应谨慎评估这一风险。

建议：

• 在面对这种情况时，我建议双方首先仔细审查合同条款，了解合同中关于事故和调查期间执行的具体规定。
• 其次，双方应积极与主管机关沟通，了解调查的要求和影响，以便做出合理的决策。
• 如果双方对合同的执行存在争议或无法达成一致意见，可以考虑寻求法律途径解决，如协商、调解或诉讼等。

如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。