结论：客服12个小时工作，上二休二的制度是否合法，需根据具体情况判断，若每日工作时间超过8小时且未安排补休或支付加班费，则不合法；若符合综合计算工时制且平均日工作时间和周工作时间不超标，同时保障劳动者休息权，则可能合法。以下为详细分析：
一、每日工作时间与加班规定
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。若客服每日工作12小时，明显超过了法定每日8小时的工作时间限制。
加班情况：若这12小时中，有4小时属于加班时间，且用人单位未按照《劳动法》第四十四条的规定支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬，则这种工作制度是不合法的。
补休情况：即使用人单位安排了补休，但每日工作时间仍超过8小时的部分，若未支付加班费，也违反了《劳动法》的相关规定。不过，若这12小时是分布在两天内（如第一天工作12小时，第二天休息），且平均每日工作时间未超过8小时（在考虑补休等因素后），则可能不构成违法，但这种情况较为特殊且需具体计算。
二、综合计算工时制
若用人单位实行的是综合计算工时制，即分别以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
周期内总工作时间：在综合计算工时制下，需计算一个周期内（如一个月）的总工作时间。若总工作时间未超过法定标准（如每月176小时，即22天×8小时），则可能合法。但需注意，即使总工作时间未超标，若某日工作时间过长（如12小时），仍可能因影响劳动者健康而违反相关规定。
休息权保障：无论实行何种工时制度，用人单位都应保障劳动者的休息权。若客服上二休二的工作制度导致劳动者连续工作过长、休息不足，则可能违反《劳动法》中关于劳动者休息权的规定。
三、实际操作中的合法性判断
在实际操作中，判断客服12个小时工作、上二休二的制度是否合法，需综合考虑以下因素：
劳动合同与规章制度：查看劳动合同和用人单位的规章制度中是否明确规定了这种工作制度，以及是否符合相关法律法规的规定。
加班费支付情况：若存在加班情况，用人单位是否按照法律规定支付了加班费。
劳动者健康与休息权：这种工作制度是否对劳动者的身体健康造成了影响，以及是否保障了劳动者的休息权。
四、建议
对于劳动者：若认为自己的工作制度不合法，可先与用人单位协商解决；协商无果的，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于用人单位：应严格遵守相关法律法规的规定，合理安排劳动者的工作时间和休息时间；若需实行特殊工时制度，应依法向劳动保障行政部门申请并获得批准。
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