建设单位在建筑物共有权被侵害的情况下，确实可以起诉，但具体情形需根据共有权的性质及侵害方式来判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、建筑物共有权的法律基础

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，建筑物区分所有权包括专有部分所有权、共有权以及共同管理权。共有权指的是业主对建筑物内的共有部分，如道路、绿地、电梯等，享有共同使用的权利。当这种共有权受到侵害时，权利人有权寻求法律保护。

二、建设单位作为起诉主体的情形

1. 建设单位保留共有部分所有权：

   • 在某些情况下，建设单位可能并未将建筑物的所有部分都出售给业主，而是保留了部分共有部分的所有权或使用权。此时，如果这部分共有权受到侵害，建设单位作为权利人，自然有权起诉侵害者。

2. 建设单位代表业主利益起诉：

   • 在建筑物交付使用后，如果业主大会或业主委员会尚未成立，或者虽然成立但未能及时行使权利，建设单位在特定情况下（如为了维护建筑物的整体利益或业主的共同利益）可能代表业主起诉侵害共有权的行为。但这种情况较为特殊，需要具体分析建设单位与业主之间的法律关系以及相关法律法规的规定。不过，在大多数情况下，建设单位并不直接代表业主起诉，而是由业主大会或业主委员会作为诉讼主体。

3. 建设单位与业主共有权受到共同侵害：

   • 如果建设单位与业主对建筑物的某些部分享有共有权，且这部分共有权受到侵害，那么建设单位与业主可以作为共同原告起诉侵害者。

三、起诉的具体流程与注意事项

1. 收集证据：

   • 在起诉前，建设单位需要收集充分的证据来证明其共有权受到侵害，如共有部分的权属证明、侵害行为的证据（如照片、视频、证人证言等）以及损害后果的证据等。

2. 确定被告：

   • 根据侵害行为的具体情况，确定适格的被告。被告可能是直接实施侵害行为的个人或单位，也可能是对侵害行为负有管理责任的单位（如物业公司）。

3. 选择管辖法院：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，选择有管辖权的法院提起诉讼。一般来说，不动产纠纷由不动产所在地人民法院管辖。

4. 撰写起诉状并提交：

   • 撰写起诉状时，应明确诉讼请求、事实与理由以及证据等。起诉状撰写完成后，向有管辖权的法院提交并缴纳诉讼费用。

四、法律后果与风险提示

• 如果建设单位起诉成功，法院可能会判决侵害者停止侵害、恢复原状、赔偿损失等。但需要注意的是，诉讼过程可能耗时较长，且存在败诉的风险。因此，在决定起诉前，建设单位应充分评估诉讼的可行性与风险。

• 另外，如果建设单位与业主之间存在关于共有权的争议或纠纷，建议先通过协商、调解等方式解决，以避免不必要的法律诉讼和成本支出。

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