结论：针对一栋房屋一部分违反森林法、一部分违反土地管理法的情况，国土局和林草局确实有权分别进行罚款，但具体罚款情况需根据违法行为的性质、情节以及相关法律法规的规定来确定。

分析说明：

1. 行政处罚权的分配：

   • 国土局（现自然资源部门的一部分）主要负责土地管理方面的法律法规执行，对于违反土地管理法的行为，如非法占用土地、改变土地用途等，有权进行行政处罚，包括罚款。
   • 林草局（或林业部门）则负责森林法等相关法律法规的执行，对于违反森林法的行为，如非法砍伐林木、非法占用林地等，同样有权进行行政处罚，包括罚款。

2. 违法行为的独立性：

   • 房屋的一部分违反森林法，另一部分违反土地管理法，这意味着存在两个独立的违法行为。每个违法行为都应当由相应的主管部门根据其职责范围进行查处。
   • 例如，如果房屋的一部分建在了非法占用的林地上，这违反了森林法；而另一部分则建在了非法占用的农用地上，这违反了土地管理法。这两个违法行为应当分别由林草局和国土局进行查处。

3. 罚款的确定：

   • 罚款的数额并非随意确定，而是需要根据违法行为的性质、情节以及相关法律法规的规定来具体确定。
   • 例如，森林法可能规定了非法占用林地的罚款标准，而土地管理法则可能规定了非法占用土地的罚款标准。国土局和林草局在查处违法行为时，应当依据这些具体规定来确定罚款数额。

法律后果与建议：

• 法律后果：如果房屋确实存在违反森林法和土地管理法的行为，且经相关部门查实，那么国土局和林草局有权分别对违法行为进行罚款。此外，还可能面临其他行政处罚，如责令恢复原状、没收违法所得等。
• 建议：
  1. 主动整改：如果房屋确实存在违法行为，建议尽快主动整改，如拆除违法建筑、恢复土地原状等，以减轻可能的行政处罚。
  2. 咨询专业：在处理此类问题时，建议咨询专业律师或相关部门，以了解具体的法律法规和处罚标准，确保整改和处罚的合法性和合理性。
  3. 配合调查：在相关部门进行调查时，应积极配合，提供必要的资料和证据，以便相关部门能够准确判断违法行为的性质和情节，从而作出合理的处罚决定。

特殊场景：

• 如果房屋的违法行为涉及多个部门或存在交叉管理的情况，可能需要多个部门联合执法或协调处理。在这种情况下，建议积极与相关部门沟通协商，共同寻求解决方案。

行动建议：

• 如果你或他人面临类似问题，建议直接向我咨询，提供详细的违法情况和相关证据，以便我能够为你提供更具体、更专业的法律建议。