故意对抗组织检查的处理方式主要取决于对抗行为的具体性质、情节严重程度以及造成的后果，一般可能涉及党纪处分、行政处罚甚至刑事责任。以下从不同角度进行详细分析：

一、党纪处分角度

如果对抗组织检查的行为发生在党内，且行为人具有党员身份，那么根据《中国共产党纪律处分条例》的相关规定，对抗组织审查的行为可能构成违纪。具体来说，如果行为人采取串供或者伪造、销毁、转移、隐匿证据，阻止他人揭发检举、提供证据材料，包庇同案人员，向组织提供虚假情况、掩盖事实，或者有其他对抗组织审查行为的，将视情节轻重给予相应的党纪处分，包括警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看直至开除党籍。

二、行政处罚角度

如果对抗组织检查的行为发生在行政领域，比如对抗政府部门的监督检查，那么根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规，行为人可能面临行政处罚。行政处罚的种类包括警告、罚款、没收违法所得、没收非法财物、责令停产停业、暂扣或者吊销许可证、暂扣或者吊销执照、行政拘留等。具体处罚种类和幅度将根据对抗行为的性质、情节以及造成的后果等因素综合确定。

三、刑事责任角度

在极端情况下，如果对抗组织检查的行为构成犯罪，比如妨碍公务罪、拒不执行判决、裁定罪等，那么行为人将面临刑事责任的追究。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，妨碍公务罪是指以暴力、威胁方法阻碍国家机关工作人员依法执行职务的行为，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金；拒不执行判决、裁定罪是指对人民法院的判决、裁定有能力执行而拒不执行，情节严重的行为，同样可能面临刑事处罚。

四、具体处理建议

1. 立即停止对抗行为：无论对抗组织检查的行为出于何种原因，都应立即停止，避免事态进一步恶化。
2. 积极配合调查：主动向组织说明情况，提供相关证据材料，配合组织的调查工作。
3. 寻求法律帮助：如果对抗行为已经涉及法律问题，建议及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，制定合理的应对策略。

总结来说，故意对抗组织检查的处理方式取决于对抗行为的性质、情节以及造成的后果。无论何种情况，都应立即停止对抗行为，积极配合调查，并在必要时寻求法律帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。