结论：船员下船后一年内提起支付令但未提优先权登记，后续一般不能直接补充申请优先权登记，但可通过其他法律途径主张优先权。具体分析如下：

1. 支付令与优先权登记的性质差异
   支付令是《民事诉讼法》规定的督促程序，旨在快速实现到期债权，其效力仅限于强制执行债务人财产。而船员工资优先权是《海商法》赋予的法定权利，需通过特定程序（如船舶扣押、拍卖）主张，且优先权登记是公示权利、对抗第三人的关键步骤。两者性质不同，支付令程序本身不涉及优先权登记的补正。

2. 优先权登记的时效限制
   根据《海商法》第二十二条，船员工资优先权需在自优先权产生之日起一年内行使。若船员在下船后一年内已提起支付令，但未在此时限内完成优先权登记（如向海事法院申请扣押船舶或办理权利登记），则优先权可能因未及时公示而丧失对第三人的对抗效力。但需注意：

   • 若支付令已生效且进入执行阶段，船员仍可申请执行债务人财产，但此时优先权仅针对债务人名下财产，不涉及船舶拍卖中的优先受偿；
     
   • 若债务人财产不足以清偿全部债务，未登记的优先权可能无法优先于其他债权人受偿。

3. 后续救济途径
   若船员未在优先权时效内登记，仍可通过以下方式主张权利：

   • 申请执行支付令：若支付令已生效，可直接申请强制执行债务人财产，但需注意执行财产的范围；
     
   • 参与船舶拍卖分配：若船舶已被其他债权人扣押并拍卖，船员可凭生效支付令申请参与分配，但此时优先权可能因未登记而无法优先受偿；
     
   • 主张普通债权：若优先权已因未登记而失效，船员工资将作为普通债权参与债务人财产分配，受偿顺序劣后于有担保的债权。

4. 实务建议
   为最大限度保障权益，船员应在下船后立即向海事法院申请优先权登记（如扣押船舶）并同步提起支付令或诉讼。若已错过登记时效，需尽快评估债务人财产状况，选择最优执行策略，并咨询专业海事律师分析具体案件中优先权是否仍可能被认定（如因不可抗力导致登记延误等特殊情形）。

总结：优先权登记具有严格的时效性和程序要求，未在法定期限内完成登记通常无法补正。但船员仍可通过执行程序主张权利，具体方案需结合案件细节制定。如有进一步疑问，可直接向我咨询海事法律问题。