关于借款签订时违约金空白后再填写是否合法的问题，其核心在于评估此行为是否构成双方的真实合意，以及是否符合相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：
合法性评估：
- 合同法原则：根据合同法的相关规定，合同的内容应当是双方当事人的真实意思表示，且内容合法、形式合规。如果在合同签订时，违约金条款留空，而后续再行填写，那么这一填写行为是否合法，关键在于是否得到了合同双方的一致同意。
- 证据要求：为了证明填写行为是双方的真实合意，最好有明确的证据支持，如双方的书面确认、电子邮件往来、聊天记录等。如果没有这些证据，填写后的违约金条款可能会因缺乏合法性基础而被认定为无效。
处理方式建议：
- 协商确认：如果违约金条款是在合同签订后填写的，建议双方重新协商并确认该条款的内容，确保双方对此均无异议，并最好以书面形式固定下来。
- 补充协议：双方可以签订一份补充协议，明确违约金的具体数额和计算方式，以及填写该条款的合法性和有效性。这份补充协议应当与主合同具有同等的法律效力。
- 法律咨询：在处理此类问题时，如果双方对合同的合法性或条款的解释存在争议，建议及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和解决方案。
综上所述，借款签订时违约金空白后再填写是否合法，取决于双方是否就此达成了一致意见，并是否符合合同法的相关规定。在处理此类问题时，建议双方充分沟通、协商确认，并考虑签订补充协议以明确权利义务。如有任何疑问或争议，可直接向我咨询，我将提供专业的法律解答和建议。