结论：逾期利息和违约金在符合一定条件下是可以一起计算的，但总计不得超过法律规定的上限。以下是对此问题的详细分析：
一、逾期利息与违约金的性质与功能
逾期利息：
- 性质：逾期利息是借款人未按照合同约定归还借款时，应向出借人支付的超期使用资金的费用，具有补偿性。
- 功能：主要补偿出借人因借款人逾期还款而遭受的资金占用损失。
违约金：
- 性质：违约金是按照当事人的约定或者法律直接规定，一方当事人违约时应向另一方支付的金钱，具有惩罚性和补偿性双重性质。
- 功能：旨在保障合同的履行和对违约方进行惩罚，同时补偿守约方因违约行为所遭受的损失。
二、逾期利息与违约金可以一起计算的条件
合同约定：
- 如果合同中明确约定了逾期利息和违约金的计算方式和标准，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么出借人可以一并主张逾期利息和违约金。
法律规定：
- 根据《民法典》及相关司法解释，虽然逾期利息和违约金可以同时主张，但它们的总额不能过高。具体来说，出借人与借款人既约定了逾期利率，又约定了违约金或其他费用时，出借人可以选择主张其中一项或多项，但总计超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍的部分，人民法院不予支持。
三、逾期利息与违约金一起计算时的注意事项
明确约定：
- 在签订合同时，双方应明确约定逾期利息和违约金的计算方式和标准，以避免后续产生不必要的争议和纠纷。例如，可以约定逾期利息按照未还本金的日万分之五计算，违约金按照未还本金的百分之十计算。
合理性审查：
- 即使逾期利息和违约金的总计未超过法定上限，法院在审理案件时仍会对其合理性进行审查。如果综合案件情况发现违约金的约定明显过高，远远超出了违约行为给对方造成的实际损失，法院可以根据公平原则和诚实信用原则酌情对违约金进行调整。
举证责任：
- 如果守约方主张违约金不足以弥补其实际损失，并要求额外计算逾期付款利息，那么守约方需要承担举证责任，证明其实际损失超出了违约金的覆盖范围。
四、实例说明
假设甲乙双方签订了一份借款合同，约定甲向乙借款100万元，借款期限为一年，年利率为10%。同时约定，如果甲逾期还款，需要按照未还本金的日万分之五支付逾期利息，并按照未还本金的百分之十支付违约金。借款到期后，甲未能按时还款，乙遂向法院提起诉讼，要求甲支付逾期利息和违约金。
- 逾期利息计算：假设甲逾期还款100天，那么逾期利息为：100万元 × 0.0005 × 100 = 5万元。
- 违约金计算：违约金为未还本金的百分之十，即100万元 × 10% = 10万元。
- 总计金额：逾期利息和违约金总计为15万元。如果合同成立时一年期贷款市场报价利率的四倍低于15万元对应的年利率（即15%/1=15%，假设一年期贷款市场报价利率的四倍为12%），则法院可能会根据公平原则和诚实信用原则对违约金进行调整，以降低总计金额至法定上限以内。
建议：在签订合同时，双方应充分考虑各种可能的情况，并明确约定逾期利息和违约金的计算方式和标准。在发生纠纷时，应及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。