针对您提出的“超市少发商品但不是故意的怎么办”这一问题，我的结论是：您可以根据具体情况选择与超市协商解决，或者依据相关法律规定维护自己的合法权益。以下是从不同角度为您进行的分析：
一、与超市协商解决
沟通协商：
- 首先，您可以尝试与超市进行沟通，说明情况，即超市在发货时少发了商品，但并非出于故意。
- 超市在了解情况后，可能会根据其内部规定或出于维护顾客关系的考虑，同意为您补发商品或进行其他形式的补偿。
保留证据：
- 在与超市沟通的过程中，建议您保留好相关证据，如购物小票、商品照片等，以便在需要时证明超市确实少发了商品。
二、依据法律规定维护权益
消费者权益保护法：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买商品时享有公平交易的权利，包括获得质量保障、价格合理、计量正确等公平交易条件。
- 如果超市少发商品，即违反了计量正确的公平交易条件，您有权要求超市进行补发或赔偿。
合同关系：
- 您与超市之间形成了买卖合同关系。超市作为卖方，有义务按照约定的数量和质量交付商品。
- 如果超市未按照约定交付商品，即构成违约。您可以根据《中华人民共和国民法典》中关于合同违约的规定，要求超市承担违约责任，如补发商品、赔偿损失等。
具体操作建议：
- 如果与超市协商无果，您可以向当地的消费者协会或市场监管部门投诉，寻求帮助。
- 在投诉时，建议您提供详细的购物信息、少发商品的情况说明以及相关证据，以便相关部门能够更好地了解情况并为您处理。
- 如果损失较大或超市态度恶劣，您还可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向法院提起诉讼。
三、特殊情况考虑
- 如果超市少发的商品价值较小，且您认为与超市协商或投诉的成本较高，您也可以选择放弃追讨，但这并不意味着超市的行为是合法的或应被接受的。
- 如果超市存在多次少发商品或故意欺诈的行为，您应坚决维护自己的合法权益，并向相关部门举报超市的违法行为。
总结与建议：在面对超市少发商品的情况时，您可以先尝试与超市进行沟通协商，看是否能够解决问题。如果协商无果，您可以依据相关法律规定维护自己的合法权益。同时，建议您在购物时保留好相关证据，以便在需要时能够证明自己的权益。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。