在转让店铺的合同纠纷中，定金是否由被告承担，并非一个绝对的问题，而是需要根据具体情况和合同约定来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 在转让店铺的合同中，如果双方明确约定了定金的承担方，那么应当遵循合同约定。例如，合同中可能规定，如果因被告（如转让方）的原因导致合同无法履行，被告需承担定金责任，即双倍返还定金或没收定金等。
   • 反之，如果合同中约定定金由原告（如受让方）承担，或者未明确约定定金承担方，则不能直接认定定金由被告承担。

2. 法律规定适用：

   • 根据《中华人民共和国民法典》中关于定金的规定，定金合同自实际交付定金时成立。定金的数额由当事人约定，但不得超过主合同标的额的百分之二十，超过部分不产生定金的效力。
   • 如果因被告违约导致合同无法履行，原告有权要求被告承担定金责任，即双倍返还定金（如果定金数额未超过法定限额）。但这一规定的前提是合同中没有相反约定，且被告确实存在违约行为。
   • 如果合同无法履行是由于原告的原因或不可抗力等因素导致，则被告通常无需承担定金责任。

3. 实际案例分析：

   • 在实际案例中，法院会根据合同的具体内容、双方当事人的行为以及相关法律法规来综合判断定金的承担方。例如，如果被告在合同签订后无正当理由拒绝履行转让义务，且合同中明确约定了定金条款，那么法院很可能会支持原告要求被告承担定金责任的诉求。
   • 反之，如果合同无法履行是由于原告未能按时支付转让款或其他原告原因导致，且合同中未明确约定定金由被告承担，那么被告则无需承担定金责任。

建议：

• 在签订转让店铺合同时，双方应明确约定定金的数额、支付方式、承担方以及违约责任等条款，以避免后续纠纷。
• 如果发生合同纠纷，双方应首先尝试通过协商解决。如果协商无果，可以寻求法律途径解决，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
• 在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。

总结：转让店铺定金是否由被告承担，取决于合同的具体约定以及相关法律法规的适用。在处理此类纠纷时，应综合考虑合同内容、双方行为以及法律规定等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。