结论：摩托车被偷后发现对方且对方愿意赔钱，您仍需要完成一些程序来确保赔偿的合法性和有效性，主要包括确认赔偿意愿与金额、签订赔偿协议、办理相关手续（如销户等，视具体情况而定）以及保留证据。

详细分析与建议：

1. 确认赔偿意愿与金额：

   • 首先，您需要与对方明确其赔偿的意愿，并就赔偿的具体金额达成一致。这通常涉及对摩托车价值的评估，包括购买价格、使用年限、折旧情况等因素。
   • 如果可能，建议双方共同委托第三方机构对摩托车进行价值评估，以确保赔偿金额的公正性和合理性。

2. 签订赔偿协议：

   • 在确认赔偿意愿和金额后，双方应签订一份书面的赔偿协议。协议中应明确赔偿的金额、支付方式、支付时间以及双方的权利和义务等。
   • 赔偿协议是双方达成合意的法律文件，具有法律效力。一旦签订，双方都应遵守协议内容，否则可能面临法律责任。

3. 办理相关手续：

   • 销户手续：如果摩托车已经丢失且无法找回，您可能需要到当地车辆管理所办理销户手续。销户时需要提供摩托车的行驶证、登记证书等相关证件，以及报警记录等证明摩托车丢失的材料。
   • 保险理赔：如果您的摩托车购买了保险，且保险条款中包含了盗窃险，那么您还可以向保险公司申请理赔。在理赔过程中，您需要提供赔偿协议、报警记录、摩托车价值评估报告等相关材料。

4. 保留证据：

   • 在整个过程中，您应保留好所有与赔偿相关的证据，包括赔偿协议、报警记录、摩托车价值评估报告、销户证明等。这些证据在后续可能出现的纠纷中将成为重要的法律依据。

额外建议：

• 在与对方协商赔偿时，建议保持冷静和理性，避免情绪化的冲突。通过友好协商达成赔偿协议，有助于维护双方的关系，并减少后续的法律纠纷。
• 如果对方在赔偿过程中出现违约行为，如拒绝支付赔偿金或拖延支付时间等，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。

后续行动指南：

• 尽快与对方联系，确认赔偿意愿和金额，并签订赔偿协议。
• 根据需要办理销户手续和保险理赔手续。
• 保留好所有相关证据，以备不时之需。

如果您在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。