针对“耕地上种树拒不整改”的问题，首先明确结论：若耕地被非法用于种树且拒不整改，可能涉及违反土地管理法规，需承担相应法律责任。以下从多个角度详细分析：
一、法律背景与规定
耕地保护原则：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，耕地是受严格保护的土地资源，未经批准不得擅自改变用途。
- 耕地主要用于农作物种植，若用于种树等非农业用途，需依法办理相关手续，如土地用途变更审批等。
非法占用耕地的法律责任：
- 若未经批准在耕地上种树，属于非法占用耕地行为，可能面临土地管理部门的处罚，包括责令限期改正、罚款等。
- 若拒不整改，土地管理部门有权采取进一步措施，如强制恢复土地原状、申请法院强制执行等。
二、处理流程与建议
与当事人沟通：
- 首先，尝试与在耕地上种树的当事人进行沟通，了解其种树的原因和意图，并告知其行为的违法性及可能面临的法律责任。
- 鼓励当事人自行整改，恢复土地原状，以避免更严重的法律后果。
向土地管理部门举报：
- 若沟通无果，可向当地土地管理部门（如国土资源局、农业农村局等）举报该违法行为。
- 土地管理部门将依法进行调查，并根据调查结果采取相应的处罚措施。
申请法院强制执行：
- 若土地管理部门作出责令限期改正的决定后，当事人仍拒不整改，土地管理部门可依法申请法院强制执行。
- 法院将根据土地管理部门的申请，对违法行为进行强制纠正，并可能对当事人处以罚款等处罚。
三、可能面临的法律后果
行政处罚：
- 当事人可能面临土地管理部门的行政处罚，包括责令限期改正、罚款等。
- 罚款的数额将根据违法行为的严重程度、占用耕地的面积等因素确定。
刑事责任：
- 在极端情况下，若非法占用耕地行为情节严重，构成犯罪的，当事人可能面临刑事责任。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法占用耕地罪可能涉及有期徒刑、拘役或罚金等刑罚。
四、特殊情况与考虑
合法种树情形：
- 若当事人在耕地上种树是经过合法审批的，如林权证、土地用途变更审批等，则不属于违法行为。
- 在此情况下，若其他人认为种树行为影响了其权益，可通过协商、调解或诉讼等途径解决纠纷。
历史遗留问题：
- 对于一些历史遗留的耕地种树问题，如过去因政策原因允许在耕地上种树等，需根据具体情况进行妥善处理。
- 在处理此类问题时，应充分考虑历史背景和政策变化，避免一刀切的处理方式。
总结与建议：针对耕地上种树拒不整改的问题，建议首先与当事人进行沟通，了解其意图并告知法律责任；若沟通无果，可向土地管理部门举报并申请处理；若仍拒不整改，土地管理部门可依法申请法院强制执行。同时，也需考虑特殊情况如合法种树情形和历史遗留问题等。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。