耕地被种树了，首先应当与种树人协商，要求其恢复耕地原状。若协商无果，可向当地自然资源主管部门举报，由主管部门责令其改正或治理，并处以罚款。

一. 与种树人协商

• 面对耕地被种树的情况，首先应当尝试与种树人进行协商，明确表达耕地的重要性以及种树对耕地造成的破坏，要求其恢复耕地原状。

二. 向自然资源主管部门举报

• 若协商无果，根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》第十二条，国家对耕地实行特殊保护，严格控制耕地转为林地等其他农用地。因此，可以向当地自然资源主管部门举报种树人的违法行为。
• 自然资源主管部门在接到举报后，会进行调查核实，并根据实际情况责令种树人改正或治理，恢复耕地原状，并可能处以罚款。

三. 法律后果

• 若种树人的行为构成非法占用耕地并改变土地用途，且数量较大，造成耕地大量毁坏，还可能触犯《中华人民共和国刑法》第三百四十二条的规定，面临刑事处罚。

我建议在与种树人协商无果后，及时向当地自然资源主管部门举报，以维护耕地的保护和合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。