修省道占用农民水井是否违法，需根据具体情况来判断，总体原则是未经合法程序审批和未给予合理补偿的强行占用行为是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、合法占用的情况
履行审批手续：
- 省道建设作为重要的基础设施项目，其占用土地（包括农民水井所在土地）必须依法办理农用地转用审批手续。
- 这类项目通常需经省级以上人民政府批准，或按照相应规定报国务院批准。若修省道项目依法取得了这些审批，即视为合法的前期步骤。
合理补偿：
- 占用土地时，应按照法律规定给予被占地农民合理的补偿。这包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物（如水井）和青苗等的补偿费用。
- 补偿标准应参照当地征地补偿标准，确保农民因土地被占用后的生活水平不降低。若水井对农民有特殊的使用价值或情感价值，也应在补偿中予以考虑。
与农民协商：
- 在占用土地前，相关部门应与农民进行充分协商，就占地事宜、补偿方式和标准等达成一致意见。这是尊重农民权益、避免纠纷的重要环节。
二、非法占用的情况
未批先占：
- 未经有权机关批准，擅自占用土地进行省道建设，违反了《土地管理法》的强制性规定。
- 这种情况下，相关部门可责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。对于水井这一特定设施，若被非法占用或破坏，农民有权要求恢复原状或赔偿损失。
补偿不合理或未补偿：
- 没有按照规定给予农民合理补偿，或在未支付补偿费用的情况下强行占用土地，侵犯了农民的合法财产权益。
- 农民有权通过法律途径要求给予合理补偿，并可追究相关单位和人员的法律责任。对于水井的补偿，应确保其价值得到充分体现。
强行占用：
- 未与农民进行协商，或虽协商但未达成一致意见就强行施工占用土地，属于严重的违法行为。
- 这种行为不仅违反了民事法律中的平等协商、自愿交易原则，还可能触犯治安管理处罚法甚至刑法。若造成农民人身伤害或财产重大损失（如水井被毁导致生活用水困难），相关责任人需承担相应的法律后果。
三、农民的权利与救济途径
面对非法占用土地（包括水井）的行为，农民有权采取以下措施维护自己的合法权益：
- 拒绝非法占地：农民有权拒绝未经合法程序的占地行为，并保护自己的水井不受非法侵害。
- 投诉举报：可以向当地政府或有关部门投诉举报非法占地行为，要求查处并恢复土地原状。对于水井的特定情况，应详细说明其价值和受影响程度。
- 寻求法律救济：若权益受损，农民可通过法律途径要求赔偿损失，并追究相关责任人的法律责任。这包括提起民事诉讼要求赔偿经济损失，以及在必要时向公安机关报案追究刑事责任。
总结来说，修省道占用农民水井是否违法，取决于是否履行了合法的审批手续、是否给予了合理的补偿以及与农民是否进行了充分的协商。政府或相关部门在进行省道建设等基础设施建设时，必须依法依规进行，充分尊重农民的合法权益。若您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。