如果房屋继承中的第二继承人去世了，那么其应继承的份额将按照法定继承顺序或遗嘱内容，转由其合法继承人继承。以下是对这一问题的详细分析：
一、法定继承情况下的处理
继承顺序：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，继承开始后，由第一顺序继承人（配偶、子女、父母）继承，第二顺序继承人（兄弟姐妹、祖父母、外祖父母）不继承。
- 如果第一顺序继承人不存在或放弃继承，则由第二顺序继承人继承。
第二继承人去世的影响：
- 若在房屋继承过程中，第二继承人去世，且其原本应继承的份额尚未实际分配，则该份额将按照法定继承顺序，转由第二继承人的合法继承人（即其配偶、子女、父母等）继承。
- 如果第二继承人没有第一顺序继承人（如配偶、子女、父母均已去世），则由其第二顺序继承人（如兄弟姐妹、祖父母、外祖父母）继承。但这种情况较为特殊，且需具体分析第二继承人的家庭情况。
二、遗嘱继承情况下的处理
遗嘱内容：
- 如果被继承人生前立有遗嘱，并明确指定了房屋的继承人，那么应按照遗嘱内容执行。
- 若遗嘱中指定了第二继承人作为房屋的继承人，但第二继承人在继承开始前或继承过程中去世，则需根据遗嘱的具体内容来确定后续处理方式。
遗嘱的效力：
- 如果遗嘱中明确规定了第二继承人去世后的替代继承人或处理方式，则按照遗嘱执行。
- 如果遗嘱未对此作出规定，且第二继承人去世导致遗嘱部分或全部无法执行，则可能引发法定继承程序，由第二继承人的合法继承人继承其应继承的份额。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：
- 在处理此类继承问题时，需收集相关证据，如被继承人的死亡证明、遗嘱（如有）、继承人的身份证明等。
- 特别是要证明第二继承人的去世时间及其与被继承人的关系，以便确定其应继承的份额及后续处理方式。
协商与调解：
- 在继承过程中，各继承人之间可能因份额分配等问题产生争议。此时，可尝试通过协商或调解的方式解决纠纷，以维护家庭和谐。
法律程序：
- 如果协商或调解无果，各继承人可依法向人民法院提起诉讼，由法院根据事实和法律规定作出判决。
举例说明：假设被继承人A有一套房屋，其遗嘱中指定第二继承人B为房屋的继承人。但在继承过程中，B去世了。此时，如果B有第一顺序继承人（如配偶、子女），则房屋份额将转由B的第一顺序继承人继承；如果B没有第一顺序继承人，则可能由B的第二顺序继承人继承，或者根据遗嘱的其他条款或法定继承程序处理。
建议：在处理房屋继承问题时，如果涉及第二继承人去世的情况，建议各继承人及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的继承方案，并依法维护自身权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。