针对您提出的“申请做劳动能力鉴定，但工伤认定书以外还有两个受伤部位怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，工伤认定书是确定工伤范围和程度的重要依据，但它并不一定涵盖所有受伤部位。如果您在工伤事故中受伤，且在工伤认定书之外还有其他受伤部位，您仍然有权申请对这些部位进行劳动能力鉴定。
具体操作步骤如下：
准备申请材料：
- 填写劳动能力鉴定申请表，这是申请劳动能力鉴定的基本文件。
- 提交完整的病历资料，包括医疗机构出具的诊断证明、检查报告、检验报告等，这些资料应涵盖您所有受伤部位的情况。特别是对于工伤认定书以外的受伤部位，要确保有充分的医疗证据支持。
向劳动能力鉴定委员会提交申请：
- 您或者您的用人单位应当及时向作出认定工伤决定所在区的劳动能力鉴定委员会提出劳动能力鉴定申请。如果因身体等原因无法亲自提出，可由近亲属代为提出。
- 提交申请时，要确保所有材料齐全，以免因材料不全而影响鉴定进程。
等待审核与鉴定：
- 劳动能力鉴定委员会在收到申请后，会及时审核申请材料。如果材料不完整，他们会以书面或电子形式一次性告知您需要补正的全部材料和合理期限。
- 一旦材料完整，劳动能力鉴定委员会将组织专家进行鉴定。鉴定过程中，专家会根据您的病历资料、临床表现等，对您的劳动能力进行综合评估。
获取鉴定结果：
- 鉴定完成后，劳动能力鉴定委员会会出具劳动能力鉴定结论书，明确您的劳动功能障碍程度和生活自理障碍程度。
- 如果您对鉴定结果有异议，可以在规定时间内向市劳动能力鉴定委员会提出再次鉴定申请。
特别提醒：
- 在申请劳动能力鉴定时，务必确保所有受伤部位都有充分的医疗证据支持，以便专家能够准确评估您的劳动能力。
- 如果您对鉴定流程或所需材料有疑问，可以提前咨询当地劳动能力鉴定委员会或相关部门，以确保申请顺利进行。
综上所述，即使工伤认定书以外还有其他受伤部位，您仍然有权申请劳动能力鉴定。只需按照上述步骤准备材料并提交申请即可。希望这些信息能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。