委托第三方收款并开票的合法性需分情况讨论，具体如下：
一、委托第三方收款的合法性
法律依据与基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，委托人可以依法委托受托人处理事务，包括委托收款。这构成了委托收款合法性的法律基础。委托代理授权应采用书面形式，并明确代理人的姓名或名称、代理事项、权限和期限，由被代理人签名或盖章，以确保委托关系的明确性和有效性。
合法性条件：
- 双方当事人需达成合意，且不违反法律法规的强制性规定。
- 委托人应谨慎选择代理人，确保其信誉良好且具备收款能力。
- 双方应签订详细的委托协议，明确权利义务，包括委托收款的范围、权限、期限等。
- 委托人应定期对代理人的收款行为进行监督和检查，确保合规性。
常见场景与要求：
- 在商业活动中，如总公司委托分公司代为收取款项等情况很常见。
- 为避免纠纷和风险，通常需要向付款方提供委托收款的证明文件（如委托收款函），付款方有义务合理审查委托手续的真实性和完整性。
二、开票的合法性
一般情况下的非法性：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项时，应向收款方取得发票，不得要求变更品名和金额。因此，在未经许可的情况下，委托第三方代为开具发票是不合法的，可能面临税务机关的处罚。
特殊情况下的合法性：
- 税务机关依法委托：根据《中华人民共和国发票管理办法》第十六条，代开发票只能向经营地税务机关申请。在税务机关依法委托的情况下，第三方代开发票是合法的。此时，被委托的单位应遵守相关的税收法律、行政法规等规定。
- 明确的代理关系：在某些有明确代理销售或服务关系的业务模式中，如果代理人基于被代理人的真实交易进行开票申报等操作，且开票方有合法的开票资格，发票内容如实反映交易情况，这种情况下委托第三方开票也是合法合规的。但此类委托必须严格遵循法律法规和税务规定，保留完整、准确的交易凭证和记录。
三、法律后果与风险提示
行政责任：
- 对于虚开发票的行为，税务机关将没收违法所得，并根据虚开金额的大小处以不同额度的罚款。虚开金额在1万元以下的，可并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款。
刑事责任：
- 依据《中华人民共和国刑法》，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，将面临三年以下有期徒刑或者拘役，并处相应罚金。情节更为严重的，将面临更长的刑期和更高的罚金，甚至可能被没收财产。
风险提示：
- 企业应严格遵守税收法规，确保开票行为的合法性和准确性。
- 对于委托收款中的开票问题，应特别注意保持交易的真实性，避免因不当操作而引发法律风险。
- 在选择委托第三方收款并开票时，务必确保该行为符合税务机关的规定，并避免任何形式的虚开或滥用发票行为。
总结与建议：
委托第三方收款并开票的合法性取决于交易的真实性和是否符合税务机关的规定。在大多数情况下，建议由实际的销售方或服务提供方自行开具发票。如果确实需要委托第三方开票，务必确保该行为符合税务机关的规定，并避免任何形式的虚开或滥用发票行为。同时，应保留完整的交易凭证和记录，以备税务机关查验。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。