结论：员工是否需要偿还公司多转的9万元，取决于借款的性质、双方约定以及相关法律规定。以下从不同角度进行分析：
借款合同关系角度
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》合同编的相关规定，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。若员工与公司之间存在明确的借款合同关系，且合同中约定了借款金额、还款期限等条款，那么员工应当按照合同约定履行还款义务。
- 分析：在此案例中，员工原本向公司借款1万元，但公司实际转账10万元。若双方未就多转的9万元形成新的借款合同或补充协议，且员工未明确表示接受这9万元作为借款，则员工可能只需偿还原本约定的1万元。然而，若员工实际使用了这9万元，且双方事后达成了还款协议或员工以行为表明接受了这9万元作为借款，则员工需要偿还全部10万元。
不当得利角度
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因他人没有法律根据，取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。
- 分析：若公司多转的9万元并非基于借款合同关系，而是由于操作失误或其他原因导致员工不当得利，那么公司有权要求员工返还这9万元。员工作为不当得利的受益人，应当返还取得的利益。
公司内部规定或双方约定角度
- 分析：若公司内部有关于员工借款的具体规定，或者双方就借款事宜有特别的约定（如借款用途、还款方式、利息计算等），则这些规定或约定将作为判断员工是否需要偿还多转款项的依据。例如，若公司规定员工借款需用于特定目的，且员工实际使用了多转的款项用于该目的，并按照约定进行了还款，则员工可能不需要额外偿还多转的款项。
法律建议：
- 对于公司而言，应尽快与员工沟通，明确多转款项的性质和还款要求。若员工拒绝偿还或双方无法达成一致，公司可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
- 对于员工而言，应仔细审查与公司之间的借款合同或相关约定，了解自己的还款义务。若认为公司多转的款项并非借款或存在其他争议，应及时与公司沟通并寻求法律帮助。
可能法律后果：
- 若员工未按照约定或法律规定偿还借款或不当得利，公司有权向法院提起诉讼要求员工偿还。法院将根据双方提供的证据和法律规定进行判决，员工可能需要承担还款责任、支付利息或承担其他法律责任。
- 若员工认为公司多转的款项存在争议或不当得利，且拒绝偿还，而公司无法提供充分证据证明员工应当偿还，则员工可能无需承担还款责任。但在此情况下，员工也应谨慎处理，避免因拒绝偿还而引发不必要的法律纠纷。