信用卡违约金在全部还清后，一般情况下是不能退还的，但在某些特殊情况下，持卡人有可能申请退还或部分减免违约金。以下是对此问题的详细分析：
一、违约金的一般性质与原则
信用卡违约金本质上是一种因违约行为而支付的无偿经济补偿，用于弥补银行因持卡人违约行为所遭受的损失。在大多数情况下，由于违约金是作为一种赔偿金而存在的，且基于双方自愿达成的协议，因此原则上是不予退还的。它作为对违约行为的经济制裁，旨在维护信用卡交易的秩序和诚信原则。
二、可申请退还违约金的特殊情况
发卡行存在过错：
- 如银行系统故障、未及时准确通知费用政策变更等导致持卡人产生违约金，持卡人在提供相关证据（如系统通知、交易记录等）后，有较大机会要求银行退还违约金。例如，银行系统升级误判还款逾期而收取的违约金，在银行核实情况属实后，通常会进行退还。
持卡人有特殊情况：
- 不可抗力因素：如遭遇重大自然灾害、突发重大疾病等不可抗力事件，导致无法按时还款。持卡人提供医院诊断书、受灾证明等相关证据，并向银行诚恳说明非恶意逾期，银行可能考虑退还违约金。
- 还款提醒缺失：若银行未按规定对持卡人进行还款提醒（如短信、电话提醒），导致持卡人不小心逾期，持卡人可向银行申诉，银行可能会酌情退还违约金。
违约金及利息超过法定标准：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，如果银行收取的违约金及利息超过了法定标准或合理范围，持卡人可以申请退还多收的违约金或降低部分利息。这需要持卡人了解相关法律法规，并提供充分证据（如信用卡账单、还款记录等）。
与银行协商沟通：
- 即使不存在上述特殊原因，持卡人也可尝试主动与银行友好协商，说明自身经济状况，强调非故意逾期，并表达今后会按时还款的意愿。部分银行在考虑维护客户关系等因素下，可能会同意退还部分或全部违约金。
三、法律途径与建议
- 在个别情况下，如果银行收取违约金的行为明显不合理或违反相关规定，持卡人可通过法律途径争取退还违约金。但需注意，法律诉讼程序相对复杂，需耗费时间、精力和费用。因此，在决定采取法律行动前，建议持卡人充分评估成本与收益。
- 建议：持卡人在遇到相关问题时，首先应与银行进行沟通协商，并保留好相关证据（如交易记录、沟通记录、证明材料等）以备不时之需。若协商无果且认为银行行为存在不合理之处，可进一步考虑咨询法律专业人士（即向我咨询）以获取更准确的解答和帮助。
综上所述，信用卡违约金能否退还取决于具体情况。在处理相关争议时，应综合考虑法律规定、协议约定及实际情况，确保公平合理地处理每一例案件。