针对您提出的问题，即公司账目还未弄清，被起诉三人合伙的厂子，但有两个人不承认的情况，以下是我的分析和建议：

1. 法律关系的梳理：

   • 首先，需要明确的是，三人合伙的厂子在法律上通常被视为合伙企业或个体工商户（具体取决于注册类型和实际情况）。在合伙关系中，各合伙人之间通常存在共同经营、共享收益、共担风险的关系。
   • 当公司账目不清时，这可能涉及到合伙企业的财务管理问题，以及各合伙人之间的权益分配和责任承担问题。

2. 账目不清的法律后果：

   • 账目不清可能导致各合伙人之间的权益无法准确界定，进而引发纠纷。在诉讼中，账目不清可能成为对方攻击的弱点，影响您的辩护效果。
   • 如果账目问题严重到构成违法或犯罪行为（如贪污、挪用资金等），则可能面临更严重的法律后果。

3. 应对策略：

   • 收集证据：首要任务是尽可能收集与账目相关的所有证据，包括但不限于银行流水、交易记录、发票、合同等。这些证据将有助于还原账目真相，证明您的清白或责任大小。
   • 聘请专业会计师：考虑聘请一位具有专业资质的会计师对账目进行审计和整理。会计师的专业意见将为您的辩护提供有力支持。
   • 法律辩护：在诉讼过程中，您需要积极准备法律辩护。这包括分析对方起诉的法律依据和事实依据，准备反驳证据和理由，以及制定合适的诉讼策略。
   • 与另外两位合伙人沟通：尽管他们目前不承认，但尝试与他们进行沟通，了解他们的立场和顾虑，看是否能够达成某种共识或妥协。这有助于减少诉讼中的对抗性，为和解或调解创造条件。

4. 关于另外两位合伙人不承认的情况：

   • 如果另外两位合伙人不承认账目问题或您的责任，这并不意味着您无法辩护。关键在于您能否提供足够的证据来证明自己的清白或责任大小。
   • 在诉讼中，法院将根据双方提供的证据和法律规定来作出判决。因此，即使另外两位合伙人不承认，只要您能够提供充分的证据，仍然有可能获得有利的判决结果。

5. 可能的法律后果：

   • 如果法院最终认定您存在责任，您可能需要承担相应的民事赔偿责任或刑事责任（如果涉及犯罪行为）。
   • 如果法院认定您无责任或责任较小，则您将免于承担相应的法律后果。

行动建议：

• 立即着手收集与账目相关的所有证据，并尽快聘请一位专业会计师进行审计和整理。
• 同时，咨询一位像我这样的专业律师，以便更好地了解您的法律权利和义务，以及制定合适的诉讼策略。
• 在诉讼过程中保持冷静和理性，积极配合律师的工作，共同应对挑战。

如果您有任何进一步的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。