在经济纠纷案件中，如果被告不同意调解并选择继续上诉，可能会产生以下几方面的影响：
诉讼周期延长：
- 一旦被告选择上诉，案件将进入二审程序。二审法院需要重新审理案件，包括审查一审法院的判决事实是否清楚、适用法律是否正确等。这一过程通常会比一审更为复杂和耗时，因此，整个诉讼周期会显著延长。对于原告而言，这意味着需要等待更长的时间才能获得最终的判决结果，可能会影响到其权益的及时实现。
诉讼成本增加：
- 上诉意味着双方都需要投入更多的时间和金钱来应对诉讼。被告需要支付上诉费用，并可能需要聘请更高级别的律师来准备二审的辩护材料。原告同样需要准备应对二审的答辩材料，并可能需要支付额外的律师费用。因此，上诉会增加双方的诉讼成本，包括时间成本和经济成本。
判决结果的不确定性增加：
- 二审法院在审理案件时，会独立对案件进行判断，并可能作出与一审不同的判决结果。这意味着，即使原告在一审中获得了有利的判决，但在二审中仍有可能面临判决结果被改判的风险。对于被告而言，上诉则提供了改变一审不利判决的机会。因此，上诉增加了判决结果的不确定性。
对双方关系的影响：
- 在经济纠纷案件中，双方往往原本就存在一定的商业关系或合作关系。上诉可能会进一步加剧双方之间的对立情绪，破坏原有的商业关系或合作关系。即使案件最终得到解决，双方之间的信任和合作基础也可能已经受到严重损害，难以恢复。
执行难度可能增加：
- 如果二审法院维持了一审的判决结果，但被告仍然拒绝履行判决义务，原告将需要申请强制执行。然而，由于上诉过程中可能涉及更多的法律程序和争议点，被告可能会利用这些程序来拖延执行或设置执行障碍。这可能会增加原告的执行难度和成本。
针对上述影响，我有以下几点建议：
在决定是否上诉前，双方应充分评估上诉的利弊：包括诉讼周期、诉讼成本、判决结果的不确定性以及对双方关系的影响等因素。如果上诉的利大于弊，那么可以选择上诉；否则，应考虑接受一审判决或寻求其他解决纠纷的方式。
在上诉过程中，双方应积极配合法院的工作：包括按时提交辩护材料、参加庭审等。同时，双方也可以尝试通过调解等方式来解决纠纷，以减少诉讼成本和时间成本。
如果二审判决结果仍然不满意，双方还可以考虑申请再审或寻求其他法律救济途径。但需要注意的是，这些途径通常都有严格的条件和限制，需要仔细评估其可行性和效果。
如有任何具体疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。