结论：员工自离时，公司不可以随意扣工资。具体能否扣工资以及扣多少，需根据是否给公司造成经济损失、劳动合同约定及当地法律法规综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、无经济损失情况下的工资支付
基本原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，工资是劳动者提供劳动的报酬，应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。
- 即使员工自动离职，只要未给公司造成经济损失，公司就应支付其已提供劳动部分的工资。
实例说明：
- 假设员工小李月工资为6000元，工作15天后自动离职，且未给公司造成任何经济损失。那么，公司应支付小李15天的工资，即3000元（6000元/月 ÷ 30天 × 15天）。
二、造成经济损失情况下的工资扣除
经济损失的认定与赔偿：
- 若员工自离给公司造成了经济损失，如未完成工作交接导致项目停滞、数据丢失，或违反保密协议、竞业限制协议给公司带来损失等，公司有权要求员工赔偿。
- 赔偿的金额需有充分证据支持，证明损失的存在及具体数额。
工资扣除的限制：
- 从员工工资中扣除赔偿金额时，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
- 若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则公司需按最低工资标准支付。
计算公式与实例：
- 假设员工小张月工资为5000元，因自离给公司造成了2000元损失。根据规定，公司每月最多可从小张工资中扣除1000元（5000元 × 20%）来弥补损失。若小张当月工资扣除后低于当地最低工资标准，则公司需按最低工资标准支付。
三、自离工资的计算与支付流程
- 计算方式：自离员工的工资应当按照其在公司的实际用工天数计算，确保劳动者获得其应得的劳动报酬。
- 支付流程：公司应在员工离职时为其结清工资。若发现员工有未完成的工作或造成的经济损失，应及时与员工协商解决，并在支付工资时进行相应的处理。
四、劳动者权益保护与建议
投诉与仲裁：
- 如果公司无故克扣自离员工的工资，劳动者有权向当地的劳动监察部门进行投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
证据保留：
- 在处理此类争议时，劳动者应保留好相关证据，如劳动合同、工资条、工作记录、离职证明等，以便在需要时提供证明。
建议：
- 劳动者在离职时也应尽量遵守公司的规章制度，做好工作交接，以减少不必要的纠纷和损失。
- 若对公司扣除工资有异议，应及时与公司沟通协商，或寻求法律援助。
总结：员工自离时，公司不可以随意扣工资。若因自离给公司造成损失，公司可依法要求赔偿，但赔偿的扣除需遵守法定限制。劳动者和公司在处理自离问题时，应遵循法律法规，确保双方权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。