在劳动争议案件中，若被告公司注销后，起诉股东的案由通常可以定为“股东损害公司债权人利益责任纠纷”。以下是对此问题的详细分析：
一、案由确定依据
公司注销后的法律后果：
- 公司注销意味着其法人资格的终止，即公司不再作为法律主体存在。
- 在公司注销前，应依法进行清算，清偿债务。若清算程序存在瑕疵或未依法清算，可能损害债权人的利益。
股东的责任：
- 根据《公司法》及相关司法解释，股东在公司注销后，若存在未依法清算、恶意处置公司财产、虚假清算等行为，导致公司无法清偿债务的，股东可能需要对公司债务承担连带责任。
- 在劳动争议案件中，若公司注销前未清偿劳动者的工资、经济补偿等债务，且股东存在上述违法行为，劳动者可以起诉股东要求承担赔偿责任。
案由的选择：
- “股东损害公司债权人利益责任纠纷”是一个较为宽泛的案由，适用于股东因违法行为损害公司债权人利益的情形。
- 在劳动争议案件中，若公司注销后股东需承担责任，选择此案由能够涵盖股东因违法行为导致的各种赔偿责任。
二、具体情形分析
股东未依法清算：
- 若股东在公司注销前未依法进行清算，或清算程序存在瑕疵，导致公司财产流失、债务未清偿的，股东可能需要对公司债务承担连带责任。
- 在此情形下，劳动者可以起诉股东，要求其承担未清偿的劳动债务。
股东恶意处置公司财产：
- 若股东在公司注销前恶意处置公司财产，如低价转让、无偿赠与等，导致公司无法清偿债务的，股东同样需要承担责任。
- 劳动者可以依据相关证据，起诉股东要求赔偿损失。
股东虚假清算：
- 若股东在公司注销时进行虚假清算，如伪造清算报告、隐瞒债务等，导致债权人利益受损的，股东也需要承担法律责任。
- 劳动者在发现此类情形后，可以及时起诉股东维护自身权益。
三、法律建议
收集证据：
- 劳动者在起诉股东前，应尽可能收集相关证据，如公司注销证明、清算报告、股东会议记录、财产处置凭证等。
- 这些证据将有助于证明股东的违法行为和劳动者的损失情况。
咨询专业律师：
- 劳动争议案件涉及法律关系复杂，且公司注销后的股东责任问题更是需要专业法律知识来支撑。
- 劳动者在起诉前，可以向我咨询，我会根据具体情况提供法律建议和诉讼策略。
及时起诉：
- 劳动者在发现股东存在违法行为且导致自身损失后，应及时起诉股东要求赔偿。
- 避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
总结来说，在劳动争议案件中，若被告公司注销后起诉股东，案由通常可以定为“股东损害公司债权人利益责任纠纷”。劳动者在起诉前应收集相关证据、咨询专业律师并及时起诉以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。