诉讼费和保全费支付给甲方后，发票的开具问题需根据费用性质及支付主体来确定，具体分析如下：
诉讼费发票的开具：
- 法院收取诉讼费：诉讼费通常是由法院根据案件性质和标的额来确定的，并由原告预交。在诉讼过程中，如果诉讼费最终由甲方（如被告）承担，且该费用已由原告预交并支付给法院，那么法院在结案后会根据判决结果，将应由甲方承担的诉讼费退还给原告，或者由甲方直接支付给原告（若原告已垫付）。在此情况下，诉讼费的发票应由法院开具，因为法院是诉讼费的收取主体。
- 特殊情况：如果诉讼费是由甲方直接支付给法院，且法院同意由甲方直接获取发票，那么发票自然由法院开具给甲方。但这种情况较为少见，通常诉讼费是由原告预交。
保全费发票的开具：
- 保全费性质：保全费是当事人为保证判决的执行或避免财产遭受损失，向法院申请对对方当事人的财产采取保全措施时所产生的费用。
- 发票开具主体：保全费同样是由法院收取，并用于支付保全过程中产生的实际费用（如查封、扣押、冻结等费用）。因此，保全费的发票也应由法院开具。如果保全费最终由甲方承担，且已由原告预交，法院在结案后会根据判决结果处理保全费的退还或支付问题，同时开具相应的发票。
特殊情况下的发票开具：
- 如果诉讼费或保全费并非直接支付给法院，而是支付给了其他机构或个人（如第三方保全服务机构）：在这种情况下，发票的开具主体将是实际收取费用的机构或个人。但需要注意的是，这种情况在正规的诉讼程序中较为少见，因为诉讼费和保全费通常都是由法院直接收取。
- 如果甲方和乙方之间有特别的约定：例如，双方约定诉讼费或保全费由某一方承担，并由该方直接向另一方开具发票（这种约定在法律上并不常见，且可能涉及税务问题）。在这种情况下，发票的开具将遵循双方的约定。但这种约定必须合法合规，且不得违反税收法律法规的规定。
建议与注意事项：
- 在诉讼过程中，建议当事人明确诉讼费和保全费的支付方式和责任承担方，以避免后续产生纠纷。
- 如果对发票的开具有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
- 需要注意的是，无论诉讼费还是保全费，其发票的开具都应遵循税收法律法规的规定，确保合法合规。