农民工工资问题，一般应优先向当地劳动保障监察部门投诉，但具体选择当地还是劳务公司所在地，需根据实际情况分情况讨论：

1. 若劳务公司或用工单位在当地有分支机构或项目部，且拖欠工资行为发生在当地：
   可直接向当地劳动保障监察部门（如劳动监察大队）投诉，或通过当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当地部门对项目情况更熟悉，调查取证更便捷，效率通常更高。例如，若农民工在某市工地工作，劳务公司虽注册在外地，但在该市有项目部，则向该市劳动部门投诉更直接。

2. 若劳务公司注册地与用工地分离，且当地无分支机构：
   可向劳务公司注册地的劳动保障监察部门投诉，或通过注册地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。此时需注意：若劳务公司未在当地设立分支机构，当地部门可能因管辖权问题无法直接处理，需转向注册地。例如，劳务公司注册在A市，但农民工在B市工作，若B市无项目部，则需向A市劳动部门投诉。

3. 若涉及多层分包或用工关系复杂：
   建议优先向当地劳动保障监察部门反映情况，由部门协调调查用工关系，明确责任主体。若当地部门因管辖权问题无法处理，会指引农民工向劳务公司所在地或实际用工单位所在地部门投诉。例如，总包单位将工程分包给劳务公司，劳务公司又转包给包工头，此时需通过劳动部门梳理用工链条，确定欠薪主体。

行动建议：

• 保留劳动合同、工资条、考勤记录等证据，明确用工单位、劳务公司名称及联系方式。
  
• 优先向当地劳动保障监察部门投诉（可通过12333热线或当地人社局官网查询联系方式），若被告知需向劳务公司所在地投诉，再转向注册地部门。
  
• 若投诉无果，可向当地或劳务公司所在地法院提起民事诉讼，要求支付工资及赔偿金。
  

法律依据：
根据《劳动保障监察条例》第13条，对用人单位的劳动保障监察，由用人单位用工所在地的县级或设区的市级劳动保障行政部门管辖。若劳务公司注册地与用工地不一致，原则上由用工地管辖，但注册地部门可协助调查。

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情提供详细解决方案。