结论：在建筑厂房的合同中，甲乙双方协商使用非国标钢材是可以的，但这一选择伴随着一系列重要的法律和商业考量，需要谨慎对待。

详细分析：

1. 合同自由原则：

   • 在民事法律关系中，合同双方享有广泛的合同自由，包括选择合同标的物的标准。因此，从法律原则上讲，甲乙双方可以协商在建筑厂房合同中使用非国标钢材。

2. 质量与安全责任：

   • 尽管合同双方可以自由约定使用非国标钢材，但这并不意味着可以忽视由此可能带来的质量和安全问题。非国标钢材可能无法满足建筑厂房的强度和耐久性要求，从而增加结构安全风险。
   • 如果因使用非国标钢材导致建筑厂房出现质量问题或安全事故，甲乙双方可能需要承担相应的法律责任，包括但不限于民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。

3. 合同条款的明确性：

   • 如果甲乙双方决定使用非国标钢材，必须在合同中明确约定钢材的具体标准、质量要求、检验方法以及违约责任等条款。这有助于在发生争议时明确双方的权利和义务，减少纠纷的发生。
   • 合同中还应包含关于非国标钢材使用可能带来的风险和责任的明确条款，以确保双方对此有充分的认识和准备。

4. 合规性审查：

   • 在使用非国标钢材之前，甲乙双方应进行合规性审查，确保该选择不会违反任何法律法规、行业标准或政府规定。例如，某些地区或行业可能对建筑材料的标准有特定要求，使用非国标钢材可能构成违法。

5. 替代方案与风险评估：

   • 在决定使用非国标钢材之前，甲乙双方应考虑是否有其他更合规、更安全的替代方案。同时，应对使用非国标钢材可能带来的风险进行全面评估，包括但不限于质量风险、安全风险、法律风险等。

建议：

• 谨慎选择：甲乙双方在决定使用非国标钢材之前，应充分了解其可能带来的风险和责任，并谨慎评估是否值得承担这些风险。
• 明确约定：如果决定使用非国标钢材，必须在合同中明确约定相关条款，以确保双方的权利和义务得到明确保障。
• 合规审查：在使用非国标钢材之前，进行合规性审查，确保不会违反任何法律法规或行业标准。
• 风险评估与应对：对使用非国标钢材可能带来的风险进行全面评估，并制定相应的应对措施和预案。

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