如果判决书中没有减去已经支付过的医药费，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 核对判决书内容：

   • 首先，仔细核对判决书中的各项费用计算，确认是否确实未扣除已支付的医药费。有时候，可能是判决书中的表述不够清晰，导致你产生了误解。

2. 与对方协商：

   • 如果确认判决书确实存在错误，即未扣除已支付的医药费，你可以尝试与对方进行协商，看是否能够达成一致意见，通过补充协议或其他方式来解决这一问题。协商过程中，保持冷静和理性，明确表达自己的诉求和理由。

3. 申请法院补正：

   • 如果协商无果，你可以向作出判决的法院提出书面申请，要求法院对判决书中的错误进行补正。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院在发现判决书中的笔误或计算错误时，应当及时作出补正裁定。
   • 申请补正的具体流程：
     • 撰写补正申请书，明确指出判决书中的错误之处，并提供相关证据（如支付凭证、收据等）以证明已支付的医药费。
     • 将补正申请书提交给作出判决的法院，并按照法院的要求缴纳相关费用（如有）。
     • 等待法院的审查和处理结果。如果法院认为你的申请有理有据，将会作出补正裁定，并重新送达判决书。

4. 提起上诉或申请再审（如适用）：

   • 如果法院未对补正申请作出处理，或者你认为补正裁定仍然存在错误，且该错误影响了判决结果的公正性，你可以在法定期限内提起上诉或申请再审。
   • 上诉或申请再审的注意事项：
     • 确保在法定期限内提出，逾期将丧失相关权利。
     • 撰写上诉状或再审申请书时，要详细阐述理由和依据，并提供充分的证据支持。
     • 遵守法院的诉讼程序和规定，积极配合法院的审理工作。

5. 寻求法律援助或咨询：

   • 如果你在处理这一问题过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求法律援助或咨询专业律师的意见。律师能够根据你的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。

在处理此类问题时，你需要注意以下几点：

• 保留好相关证据：如支付凭证、收据、医疗记录等，这些证据将是你证明已支付医药费的重要依据。
• 及时行动：一旦发现判决书存在错误，应尽快采取行动，以免错过申请补正、上诉或再审的法定期限。
• 保持沟通：与对方和法院保持积极沟通，有助于问题的顺利解决。

如果你在处理过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。