针对您提出的“独生子女中考加分母亲有养老保险就不给加分是否合法”的问题，这实际上涉及两个不同领域的政策：一是独生子女中考加分政策，二是养老保险政策。下面我将分别就这两个方面进行详细解答。

首先，关于独生子女中考加分政策，这通常是由地方政府根据当地实际情况制定的。以兰陵县为例，其独生子女和农村合法生育双女家庭中考加分政策主要关注的是考生的学籍和计划生育管理情况，以及是否持有独生子女证等相关证明材料。政策中并未提及父母是否拥有养老保险作为加分或不加分的条件。因此，从兰陵县的政策来看，母亲有养老保险并不应成为影响独生子女中考加分的因素。

其次，关于养老保险政策，这主要是保障退休人员的基本生活，与独生子女中考加分无直接关联。根据《国务院关于完善企业职工基本养老保险制度的决定》以及相关省份的具体实施办法，养老保险的待遇计发主要依据参保人员的累计缴费年限、缴费基数等因素，并未将是否为独生子女父母作为额外的补助条件。

综合以上两点，我们可以得出结论：独生子女中考加分政策与父母是否拥有养老保险是两个独立的政策体系，它们之间不存在直接的关联或影响。因此，如果某地政策规定“独生子女中考加分母亲有养老保险就不给加分”，这一规定可能并不符合一般的中考加分政策制定原则，也可能存在对政策理解的偏差或执行上的不当。

为了确保您的权益得到保障，我建议您：

1. 仔细查阅当地教育部门或卫生健康部门发布的关于独生子女中考加分的具体政策文件，了解加分条件和所需证明材料。
2. 如果发现政策执行中存在不当之处或疑问，可以向当地教育部门或卫生健康部门咨询并寻求解答。
3. 如有必要，也可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。