用人单位经营困难时，不能直接少发工资，而应与劳动者协商一致，并在遵守相关法律法规的前提下进行。以下是对这一问题的详细分析：

一、合法协商是前提

当用人单位面临经营困难时，为了稳定工作岗位和减少裁员风险，与劳动者进行协商一致调整工资是合法且可行的做法。这一做法的依据来源于《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，即用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资等。

二、协商一致的具体要求

1. 充分沟通：用人单位必须与劳动者进行充分的沟通，明确说明经营困难的情况、调整工资的原因、方案及影响，确保劳动者充分了解并理解调整的必要性。
2. 双方同意：调整工资必须基于双方的自愿和同意。用人单位不能单方面决定，而应与劳动者达成一致意见。这是保障劳动者权益、维护劳动关系稳定的重要原则。
3. 书面形式：虽然法律并未强制要求协商一致的结果必须以书面形式呈现，但为了避免后续的纠纷和误解，建议用人单位将协商结果以书面形式固定下来，作为双方共同遵守的依据。

三、遵守最低工资标准等法律规定

即使用人单位与劳动者达成了协商一致，也必须在调整过程中严格遵守国家的法律法规。特别是，调整后的工资水平不得低于当地的最低工资标准。这是保障劳动者基本生活权益的重要底线，任何用人单位和个人都不得违反。

四、未经协商擅自调整的后果

如果用人单位未经与劳动者协商，或者虽然提出了协商但未取得劳动者同意，就单方面决定少发工资，这种行为将违反《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。劳动者有权要求用人单位按照原劳动合同的约定支付工资，并在用人单位拒绝时通过向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等途径维护自己的合法权益。

五、实操建议

1. 全面评估与沟通：用人单位应全面评估经营困难的严重程度，制定详细的调整工资方案，并与劳动者进行充分沟通，解释调整的原因、目的和预期效果。
2. 透明与公正：在沟通过程中保持开放、透明的态度，确保调整工资的过程公正、合理，避免歧视性对待任何劳动者。
3. 关注特殊群体：对家庭经济困难、生活负担重的劳动者给予特别关注和照顾，提供必要的补助或援助措施。

总结来说，用人单位在经营困难时不能直接少发工资，而应与劳动者进行协商一致，并在遵守相关法律法规的前提下进行。如果用人单位未经协商擅自调整工资，将可能面临法律责任和劳动纠纷。因此，建议用人单位在处理此类问题时务必谨慎行事，确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。