结论：农村购买同村房屋并一同确权办理房产证是否合法，需分情况讨论，关键在于是否符合法定程序及实质要件。以下从法律角度展开分析：

1. 若交易符合法定程序，确权合法

根据《土地管理法》第六十二条及《民法典》物权编相关规定，农村房屋买卖需满足以下条件：

• 主体资格：买卖双方须为同一集体经济组织成员（即同村村民），且买方需符合“一户一宅”原则（即名下无其他宅基地）。
• 程序合规：需签订书面买卖合同，并经村委会书面同意（部分地区要求公示无异议），随后向乡镇政府申请宅基地使用权变更登记，最终办理房产证。
• 实质要件：房屋无权属争议（如未被抵押、查封），且原宅基地使用权人已放弃原宅基地（避免“一户多宅”）。

若满足上述条件，确权行为合法，房产证具有法律效力，买方取得房屋所有权及宅基地使用权。

2. 若存在以下情形，确权可能违法

• 主体不适格：买方非同村村民，或买方已拥有其他宅基地（违反“一户一宅”原则）。
• 程序瑕疵：未签订书面合同、未经村委会同意、未办理宅基地使用权变更登记直接办房产证。
• 实质违法：房屋存在权属争议（如原卖方无权处分）、宅基地面积超标未处理、买卖行为违反地方性法规（如部分地区禁止宅基地流转）。

若存在上述情形，确权行为可能被认定为违法，房产证可能被撤销，买方可能面临房屋被收回、交易无效等风险。

3. 实务建议

• 核查程序：确认买卖合同、村委会同意文件、宅基地变更登记手续是否齐全。
• 咨询当地部门：因宅基地政策具有地域性（如部分地区允许内部流转，部分禁止），建议向当地自然资源局（原国土局）或农业农村局咨询具体要求。
• 补救措施：若程序存在瑕疵，可尽快补办相关手续（如补签合同、申请变更登记）；若主体不适格，建议通过赠与、继承等合法方式取得房屋。

总结：农村房屋买卖确权的合法性需结合主体、程序、实质要件综合判断。若您已办理房产证，建议核对交易过程是否符合上述条件；若存在瑕疵，可进一步向我咨询具体补救方案。